RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 MON2Q7Z3U7 1717 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXB3-208ENST00000476342 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXB3-208ENST00000476342 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
HOXB3-208ENST00000476342 MYOM1P52179 1685 aa41.08■■■■■ 4.17
HOXB3-208ENST00000476342 POLR3GLQ9BT43 218 aa41.07■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 A0A1W2PP64 1363 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 NRKQ7Z2Y5 1582 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 SSH2Q76I76 1423 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
HOXB3-208ENST00000476342 LRP6O75581 1613 aa41■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 ABTB2Q8N961 1025 aa41■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 ABCA3Q99758 1704 aa40.95■■■■■ 4.15
HOXB3-208ENST00000476342 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.94■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 PIK3C2AO00443 1686 aa40.93■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 PLEKHG5O94827 1062 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 NUTM2GQ5VZR2 741 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 NLRP13Q86W25 1043 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
HOXB3-208ENST00000476342 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
HOXB3-208ENST00000476342 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
HOXB3-208ENST00000476342 ADAMTS2O95450 1211 aa40.86■■■■■ 4.13
HOXB3-208ENST00000476342 NLRP6P59044 892 aa40.86■■■■■ 4.13
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC7Q96M83 1385 aa40.85■■■■■ 4.13
HOXB3-208ENST00000476342 USP19O94966 1318 aa40.83■■■■■ 4.13
HOXB3-208ENST00000476342 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.81■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 USP54Q70EL1 1684 aa40.79■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 NSD3Q9BZ95 1437 aa40.79■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 NME9Q86XW9 330 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 C8orf37Q96NL8 207 aa40.77■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 USP31Q70CQ4 1352 aa40.77■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 SLIT3O75094 1523 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-208ENST00000476342 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.76■■■■■ 4.11
HOXB3-208ENST00000476342 PANK3Q9H999 370 aa40.75■■■■■ 4.11
HOXB3-208ENST00000476342 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXB3-208ENST00000476342 GCP02774 474 aa40.72■■■■■ 4.11
HOXB3-208ENST00000476342 NGLY1Q96IV0 654 aa40.72■■■■■ 4.11
HOXB3-208ENST00000476342 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.68■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 AFF2P51816 1311 aa40.67■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 COG3Q96JB2 828 aa40.67■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.66■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 FYB1O15117 783 aa40.66■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 PRDM11Q9NQV5 511 aa40.65■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 KIAA0232Q92628 1395 aa40.65■■■■■ 4.1
HOXB3-208ENST00000476342 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 CPDO75976 1380 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 PLCH1Q4KWH8 1693 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.62■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 FAM83GA6ND36 823 aa40.6■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.6■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 SLIT2O94813 1529 aa40.6■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 NFAT5O94916 1531 aa40.6■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 SOX12O15370 315 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 USP21Q9UK80 565 aa40.58■■■■■ 4.09
HOXB3-208ENST00000476342 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa40.54■■■■■ 4.08
HOXB3-208ENST00000476342 CHRNA2Q15822 529 aa40.53■■■■■ 4.08
HOXB3-208ENST00000476342 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.53■■■■■ 4.08
HOXB3-208ENST00000476342 NSD2O96028 1365 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZBTB7CA1YPR0 619 aa40.51■■■■■ 4.08
HOXB3-208ENST00000476342 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 BTG4Q9NY30 223 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 LTN1O94822 1766 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 UNC5CLQ8IV45 518 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.48■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 NRAPQ86VF7 1730 aa40.47■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.47■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 ABCC6O95255 1503 aa40.45■■■■■ 4.07
HOXB3-208ENST00000476342 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
HOXB3-208ENST00000476342 COL18A1P39060 1754 aa40.43■■■■■ 4.06
HOXB3-208ENST00000476342 POTEAQ6S8J7 498 aa40.42■■■■■ 4.06
HOXB3-208ENST00000476342 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
HOXB3-208ENST00000476342 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa40.41■■■■■ 4.06
HOXB3-208ENST00000476342 ATRNO75882 1429 aa40.41■■■■■ 4.06
HOXB3-208ENST00000476342 EVA1CP58658 441 aa40.35■■■■■ 4.05
HOXB3-208ENST00000476342 VPS72Q15906 364 aa40.35■■■■■ 4.05
HOXB3-208ENST00000476342 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
HOXB3-208ENST00000476342 RGPD5Q99666 1765 aa40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms