RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.26■■□□□ 1.31
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ATG4B-216ENST00000475195 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-216ENST00000475195 USP47Q96K76 1375 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-216ENST00000475195 SOCS7O14512 581 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-216ENST00000475195 SSH2Q76I76 1423 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-216ENST00000475195 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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ATG4B-216ENST00000475195 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-216ENST00000475195 SLIT2O94813 1529 aa23.18■■□□□ 1.3
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ATG4B-216ENST00000475195 ABTB2Q8N961 1025 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-216ENST00000475195 FAM83GA6ND36 823 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-216ENST00000475195 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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ATG4B-216ENST00000475195 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 USP19O94966 1318 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 TMF1P82094 1093 aa23.13■■□□□ 1.29
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ATG4B-216ENST00000475195 ATRNO75882 1429 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHG5O94827 1062 aa23.12■■□□□ 1.29
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ATG4B-216ENST00000475195 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 TMC1Q8TDI8 760 aa23.1■■□□□ 1.29
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ATG4B-216ENST00000475195 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 GCP02774 474 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 NLRP6P59044 892 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 CDCA8Q53HL2 280 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-216ENST00000475195 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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ATG4B-216ENST00000475195 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 PIK3C2AO00443 1686 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 CPDO75976 1380 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA0232Q92628 1395 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 VPS72Q15906 364 aa23.05■■□□□ 1.28
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ATG4B-216ENST00000475195 A0A1W2PP64 1363 aa23.03■■□□□ 1.28
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ATG4B-216ENST00000475195 SLIT3O75094 1523 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 USP31Q70CQ4 1352 aa23.02■■□□□ 1.28
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ATG4B-216ENST00000475195 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-216ENST00000475195 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 RGS12O14924 1447 aa22.99■■□□□ 1.27
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ATG4B-216ENST00000475195 CHRNA2Q15822 529 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 GLI3P10071 1580 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 USP54Q70EL1 1684 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 NME9Q86XW9 330 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 COL18A1P39060 1754 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 NFAT5O94916 1531 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 MYOM1P52179 1685 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.89■■□□□ 1.26
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ATG4B-216ENST00000475195 FYB1O15117 783 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 EVA1CP58658 441 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 STRN4Q9NRL3 753 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 COG3Q96JB2 828 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 ABCC6O95255 1503 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-216ENST00000475195 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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