RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 BTG4Q9NY30 223 aa26.61■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 ABCA3Q99758 1704 aa26.59■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.58■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.58■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.57■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 ATP7BP35670 1465 aa26.56■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 CCDC125Q86Z20 511 aa26.56■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 ALS2Q96Q42 1657 aa26.56■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 ACEP12821 1306 aa26.55■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 A0A0G2JS52 829 aa26.54■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 MYT1Q01538 1121 aa26.54■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.54■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.53■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.53■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.53■■□□□ 1.84
SYP-205ENST00000472598 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.51■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 CABP2Q9NPB3 220 aa26.51■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.51■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.5■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 CHRNA2Q15822 529 aa26.5■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.49■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.48■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 ITSN1Q15811 1721 aa26.48■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 KIAA0232Q92628 1395 aa26.46■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 ABTB2Q8N961 1025 aa26.46■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 NRAPQ86VF7 1730 aa26.45■■□□□ 1.83
SYP-205ENST00000472598 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.45■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 FAM182BQ5T319 152 aa26.44■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 STRN4Q9NRL3 753 aa26.44■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.43■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.42■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.41■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 CABP1Q9NZU7 370 aa26.41■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.4■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.4■■□□□ 1.82
SYP-205ENST00000472598 EVA1CP58658 441 aa26.38■■□□□ 1.81
SYP-205ENST00000472598 USP35Q9P2H5 1018 aa26.38■■□□□ 1.81
SYP-205ENST00000472598 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.36■■□□□ 1.81
SYP-205ENST00000472598 NLRP13Q86W25 1043 aa26.35■■□□□ 1.81
SYP-205ENST00000472598 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SYP-205ENST00000472598 GCP02774 474 aa26.33■■□□□ 1.81
SYP-205ENST00000472598 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.32■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 EVC2Q86UK5 1308 aa26.32■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 USP19O94966 1318 aa26.31■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 NLRP6P59044 892 aa26.3■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.3■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 BAG6P46379 1132 aa26.29■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.28■■□□□ 1.8
SYP-205ENST00000472598 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.26■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 SSH2Q76I76 1423 aa26.26■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 USP6P35125 1406 aa26.25■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 CPDO75976 1380 aa26.25■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.25■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 TRIM37O94972 964 aa26.23■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 BARGINQ6ZT62 677 aa26.22■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.22■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 USP47Q96K76 1375 aa26.21■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.21■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 PDE3BQ13370 1112 aa26.21■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 TESK2Q96S53 571 aa26.21■■□□□ 1.79
SYP-205ENST00000472598 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.2■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 SOX12O15370 315 aa26.19■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.18■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.18■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.16■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 APBA3O96018 575 aa26.14■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 AKAP12Q02952 1782 aa26.14■■□□□ 1.78
SYP-205ENST00000472598 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.13■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.13■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.12■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.12■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 SLIT3O75094 1523 aa26.12■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 PIK3C2AO00443 1686 aa26.12■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 TMC1Q8TDI8 760 aa26.11■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.1■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 CRB1P82279 1406 aa26.09■■□□□ 1.77
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