RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP1-207ENST00000471650 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1-207ENST00000471650 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP1-207ENST00000471650 ARHGEF10O15013 1369 aa15.36■□□□□ 0.05
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SH3BP1-207ENST00000471650 ATP7BP35670 1465 aa15.17■□□□□ 0.02
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SH3BP1-207ENST00000471650 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.16■□□□□ 0.02
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SH3BP1-207ENST00000471650 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
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SH3BP1-207ENST00000471650 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
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