RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	SSH2	Q76I76	1423 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	MST1R	Q04912	1400 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.82	■■■□□ 2.68
MTA1-209	ENST00000469140	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MTA1-209	ENST00000469140	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MTA1-209	ENST00000469140	NME9	Q86XW9	330 aa		31.78	■■■□□ 2.68
MTA1-209	ENST00000469140	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	COG3	Q96JB2	828 aa		31.74	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	PSME1	Q06323	249 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.71	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.7	■■■□□ 2.67
MTA1-209	ENST00000469140	FOXO3	O43524	673 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	MTHFS	P49914	203 aa		31.66	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.66	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.64	■■■□□ 2.66
MTA1-209	ENST00000469140	CFAP53	Q96M91	514 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	NLRP6	P59044	892 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.57	■■■□□ 2.65
MTA1-209	ENST00000469140	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.57	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	31.56	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	INSR	P06213	1382 aa		31.56	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.53	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.52	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	FBLN1	P23142	703 aa		31.52	■■■□□ 2.64
MTA1-209	ENST00000469140	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.49	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	PXDN	Q92626	1479 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
MTA1-209	ENST00000469140	NUDC	Q9Y266	331 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	SOX12	O15370	315 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	USP19	O94966	1318 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MTA1-209	ENST00000469140	SLIT3	O75094	1523 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	TOM1	O60784	492 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	GC	P02774	474 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	FLT4	P35916	1363 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	NFAT5	O94916	1531 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	AMPH	P49418	695 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	31.34	■■■□□ 2.61
MTA1-209	ENST00000469140	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	IL13	P35225	146 aa		31.32	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.32	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.32	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	HOXC9	P31274	260 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.26	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.26	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.25	■■■□□ 2.59
MTA1-209	ENST00000469140	IP6K1	Q92551	441 aa		31.25	■■■□□ 2.59
MTA1-209	ENST00000469140	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
MTA1-209	ENST00000469140	FCHSD2	O94868	740 aa		31.23	■■■□□ 2.59
MTA1-209	ENST00000469140	LTN1	O94822	1766 aa		31.23	■■■□□ 2.59

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