RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		24.93	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	24.92	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	SLC24A1	O60721	1099 aa		24.91	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		24.91	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	TESK2	Q96S53	571 aa		24.91	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	TMC1	Q8TDI8	760 aa		24.9	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	ALS2	Q96Q42	1657 aa		24.89	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	24.89	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	USP21	Q9UK80	565 aa		24.88	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	TMF1	P82094	1093 aa		24.87	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		24.85	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	24.84	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	ABTB2	Q8N961	1025 aa		24.84	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	AKAP12	Q02952	1782 aa		24.84	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	24.83	■■□□□ 1.57
USP19-210	ENST00000465902	USP6	P35125	1406 aa		24.82	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	ABCA3	Q99758	1704 aa		24.82	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	24.81	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		24.81	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		24.79	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	24.79	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	CDCA8	Q53HL2	280 aa		24.79	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	24.79	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	ATRN	O75882	1429 aa		24.78	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	RGS12	O14924	1447 aa		24.78	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		24.77	■■□□□ 1.56
USP19-210	ENST00000465902	NLRP13	Q86W25	1043 aa		24.76	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		24.75	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	NLRP6	P59044	892 aa		24.75	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		24.75	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		24.75	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		24.74	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	24.73	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		24.73	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	24.73	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	SLIT2	O94813	1529 aa		24.72	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		24.72	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		24.71	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	SSH2	Q76I76	1423 aa		24.71	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	24.71	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PP64	1363 aa		24.7	■■□□□ 1.55
USP19-210	ENST00000465902	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		24.7	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	PIK3C2A	O00443	1686 aa		24.7	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	FAM83G	A6ND36	823 aa		24.7	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	24.7	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		24.7	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		24.69	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		24.69	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	USP19	O94966	1318 aa		24.66	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		24.66	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0232	Q92628	1395 aa		24.66	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	SOX12	O15370	315 aa		24.65	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	GC	P02774	474 aa		24.65	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	CHRNA2	Q15822	529 aa		24.65	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		24.65	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	NME9	Q86XW9	330 aa		24.64	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	BTG4	Q9NY30	223 aa		24.64	■■□□□ 1.54
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		24.64	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		24.63	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	24.63	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	24.63	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	VPS72	Q15906	364 aa		24.62	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	MYOM1	P52179	1685 aa		24.62	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		24.59	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	SLIT3	O75094	1523 aa		24.59	■■□□□ 1.53
USP19-210	ENST00000465902	STRN4	Q9NRL3	753 aa		24.57	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	CPD	O75976	1380 aa		24.56	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	NRAP	Q86VF7	1730 aa		24.56	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	GLI3	P10071	1580 aa		24.56	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	EVA1C	P58658	441 aa		24.56	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	USP31	Q70CQ4	1352 aa		24.55	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	24.55	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	24.55	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	COG3	Q96JB2	828 aa		24.53	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	USP54	Q70EL1	1684 aa		24.52	■■□□□ 1.52
USP19-210	ENST00000465902	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		24.51	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		24.51	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		24.51	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		24.51	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		24.5	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		24.5	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		24.49	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	LTN1	O94822	1766 aa		24.49	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	RGPD5	Q99666	1765 aa		24.49	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JS52	829 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	FYB1	O15117	783 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	NFAT5	O94916	1531 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	MYT1	Q01538	1121 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		24.48	■■□□□ 1.51

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