RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-214ENST00000465399 MYT1Q01538 1121 aa20.72■□□□□ 0.91
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ATG4B-214ENST00000465399 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.63■□□□□ 0.89
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ATG4B-214ENST00000465399 RREB1Q92766 1687 aa20.43■□□□□ 0.86
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ATG4B-214ENST00000465399 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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ATG4B-214ENST00000465399 SLIT3O75094 1523 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-214ENST00000465399 EVC2Q86UK5 1308 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-214ENST00000465399 APBA3O96018 575 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-214ENST00000465399 NLRP6P59044 892 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-214ENST00000465399 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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ATG4B-214ENST00000465399 CRB1P82279 1406 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.39■□□□□ 0.85
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ATG4B-214ENST00000465399 COL18A1P39060 1754 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 LRRC37A3O60309 1634 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 RGPD5Q99666 1765 aa20.36■□□□□ 0.85
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ATG4B-214ENST00000465399 SBF2Q86WG5 1849 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 PEAK1Q9H792 1746 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 NEUROD1Q13562 356 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-214ENST00000465399 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.33■□□□□ 0.84
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