RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.06■□□□□ 0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BTG4Q9NY30 223 aa15.05■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATP7BP35670 1465 aa15.05■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.04■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.04■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.03■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.03■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15.02■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.02■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLEKHG5O94827 1062 aa15.02■□□□□ -0
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRP5O75197 1615 aa15.02□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BAG6P46379 1132 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DISP2A7MBM2 1401 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A0G2JS52 829 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYT1Q01538 1121 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDK19Q9BWU1 502 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIAA0232Q92628 1395 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ACEP12821 1306 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CPDO75976 1380 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP19O94966 1318 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHRNA2Q15822 529 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BARGINQ6ZT62 677 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SSH2Q76I76 1423 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM182BQ5T319 152 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABTB2Q8N961 1025 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RREB1Q92766 1687 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NLRP13Q86W25 1043 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STRN4Q9NRL3 753 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EVA1CP58658 441 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GCP02774 474 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM37O94972 964 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP6P35125 1406 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL18A1P39060 1754 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLIT3O75094 1523 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PDE3BQ13370 1112 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SBF2Q86WG5 1849 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-202ENST00000460041 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CABP2Q9NPB3 220 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP35Q9P2H5 1018 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PIK3C2AO00443 1686 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AKAP12Q02952 1782 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 APBA3O96018 575 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PEAK1Q9H792 1746 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRB1P82279 1406 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CABP1Q9NZU7 370 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRC37A3O60309 1634 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NLRP6P59044 892 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EVC2Q86UK5 1308 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGPD5Q99666 1765 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBPF14Q5TI25 921 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BCL9O00512 1426 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms