RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.62■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.62■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.61■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.59■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 RREB1Q92766 1687 aa29.58■■■□□ 2.33
SPDYE2B-202ENST00000455020 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SPDYE2B-202ENST00000455020 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SPDYE2B-202ENST00000455020 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.54■■■□□ 2.32
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.54■■■□□ 2.32
SPDYE2B-202ENST00000455020 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SPDYE2B-202ENST00000455020 POGKQ9P215 609 aa29.54■■■□□ 2.32
SPDYE2B-202ENST00000455020 ITSN1Q15811 1721 aa29.51■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.48■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.48■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.47■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIAA0232Q92628 1395 aa29.47■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 TRIM37O94972 964 aa29.46■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.46■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATP7BP35670 1465 aa29.46■■■□□ 2.31
SPDYE2B-202ENST00000455020 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.43■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 CHRNA2Q15822 529 aa29.42■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.41■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.41■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.39■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 STRN4Q9NRL3 753 aa29.39■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.39■■■□□ 2.3
SPDYE2B-202ENST00000455020 SSH2Q76I76 1423 aa29.37■■■□□ 2.29
SPDYE2B-202ENST00000455020 APBA3O96018 575 aa29.37■■■□□ 2.29
SPDYE2B-202ENST00000455020 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.34■■■□□ 2.29
SPDYE2B-202ENST00000455020 USP35Q9P2H5 1018 aa29.33■■■□□ 2.29
SPDYE2B-202ENST00000455020 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 YY1P25490 414 aa29.31■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.31■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 BARGINQ6ZT62 677 aa29.29■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 PEAK1Q9H792 1746 aa29.28■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.27■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
SPDYE2B-202ENST00000455020 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 PDE3BQ13370 1112 aa29.24■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.24■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 CASZ1Q86V15 1759 aa29.24■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 LRRC37A3O60309 1634 aa29.23■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 SBF2Q86WG5 1849 aa29.23■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 CPDO75976 1380 aa29.22■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.21■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 USP19O94966 1318 aa29.2■■■□□ 2.27
SPDYE2B-202ENST00000455020 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.2■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.2■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.2■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 ACEP12821 1306 aa29.2■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 EVA1CP58658 441 aa29.19■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.19■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 NBPF14Q5TI25 921 aa29.19■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.19■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPON1Q9HCB6 807 aa29.17■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 CDK19Q9BWU1 502 aa29.16■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 KCNQ2O43526 872 aa29.15■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.14■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.14■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.14■■■□□ 2.26
SPDYE2B-202ENST00000455020 MYOM1P52179 1685 aa29.13■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 ABTB2Q8N961 1025 aa29.11■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 CRB1P82279 1406 aa29.11■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.09■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.09■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.09■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 UTRNP46939 3433 aa29.09■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 AKAP12Q02952 1782 aa29.08■■■□□ 2.25
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLIT3O75094 1523 aa29.07■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 COL18A1P39060 1754 aa29.07■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 GCP02774 474 aa29.06■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.06■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.05■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 PIK3C2AO00443 1686 aa29.03■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 STAC3Q96MF2 364 aa29.03■■■□□ 2.24
SPDYE2B-202ENST00000455020 NLRP13Q86W25 1043 aa29.01■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 PLSCR1O15162 318 aa29■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.99■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 RGPD5Q99666 1765 aa28.98■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.98■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.98■■■□□ 2.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 USP6P35125 1406 aa28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms