RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 ATRNO75882 1429 aa26.12■■□□□ 1.77
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CXorf40A-210ENST00000448332 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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CXorf40A-210ENST00000448332 VPS72Q15906 364 aa25.95■■□□□ 1.74
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CXorf40A-210ENST00000448332 AKAP12Q02952 1782 aa25.92■■□□□ 1.74
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CXorf40A-210ENST00000448332 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.87■■□□□ 1.73
CXorf40A-210ENST00000448332 PIK3C2AO00443 1686 aa25.87■■□□□ 1.73
CXorf40A-210ENST00000448332 SLC24A1O60721 1099 aa25.86■■□□□ 1.73
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CXorf40A-210ENST00000448332 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.84■■□□□ 1.73
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CXorf40A-210ENST00000448332 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.82■■□□□ 1.72
CXorf40A-210ENST00000448332 SSH2Q76I76 1423 aa25.81■■□□□ 1.72
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CXorf40A-210ENST00000448332 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
CXorf40A-210ENST00000448332 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
CXorf40A-210ENST00000448332 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.78■■□□□ 1.72
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CXorf40A-210ENST00000448332 TMF1P82094 1093 aa25.75■■□□□ 1.71
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CXorf40A-210ENST00000448332 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.73■■□□□ 1.71
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CXorf40A-210ENST00000448332 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.73■■□□□ 1.71
CXorf40A-210ENST00000448332 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.73■■□□□ 1.71
CXorf40A-210ENST00000448332 USP35Q9P2H5 1018 aa25.73■■□□□ 1.71
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CXorf40A-210ENST00000448332 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.7■■□□□ 1.71
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CXorf40A-210ENST00000448332 EP400Q96L91 3159 aa25.69■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 USP54Q70EL1 1684 aa25.68■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 CRB1P82279 1406 aa25.66■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 NME9Q86XW9 330 aa25.66■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 NFAT5O94916 1531 aa25.66■■□□□ 1.7
CXorf40A-210ENST00000448332 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.65■■□□□ 1.7
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CXorf40A-210ENST00000448332 ABCC6O95255 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
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