RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434435.1

SMARCAL1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1, human

TSL 4

Gene SMARCAL1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.73	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NSD2	O96028	1365 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NME9	Q86XW9	330 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FYB1	O15117	783 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ANP32C	O43423	234 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	COG3	Q96JB2	828 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NLRP6	P59044	892 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RALBP1	Q15311	655 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SLIT3	O75094	1523 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LTN1	O94822	1766 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SMARCAL1-208	ENST00000434435	USP19	O94966	1318 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NFAT5	O94916	1531 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MIER1	Q8N108	512 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SOX12	O15370	315 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	HSPA1L	P34931	641 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GC	P02774	474 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FBLN1	P23142	703 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MTHFS	P49914	203 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ABCC6	O95255	1503 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SMARCAL1-208	ENST00000434435	COL18A1	P39060	1754 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CPD	O75976	1380 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FLT4	P35916	1363 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	AMPH	P49418	695 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CFAP53	Q96M91	514 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31.21	■■■□□ 2.59

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