RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 EPS15P42566 896 aa15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 PRKAR2BP31323 418 aa15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 CFTRP13569 1480 aa15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 WDR63Q8IWG1 891 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 FOSBP53539 338 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 FYB1O15117 783 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
TNS1-207ENST00000430930 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD1Q15327 319 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 SDF4Q9BRK5 362 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ERBINQ96RT1 1412 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 NFKBIBQ15653 356 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ARAP1Q96P48 1450 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TXLNAP40222 546 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ODF2Q5BJF6 829 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 PRAM1Q96QH2 718 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 MYO6Q9UM54 1294 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 KINO60870 393 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 SMARCE1Q969G3 411 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TSPY26PQ9H489 355 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TOP2BQ02880 1626 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 TIAM1Q13009 1591 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 SYNJ1O43426 1573 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-207ENST00000430930 OFD1O75665 1012 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 JMYQ8N9B5 988 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 AFAP1Q8N556 730 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CDK19Q9BWU1 502 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 SPG7Q9UQ90 795 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 DAPK1P53355 1430 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 NEK4P51957 841 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 PDILTQ8N807 584 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 TRAK2O60296 914 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 ZNF428Q96B54 188 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 DACH1Q9UI36 760 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 15.5
TNS1-207ENST00000430930 CAGE1Q8TC20 777 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 MAP7D2Q96T17 732 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 SLC4A2P04920 1241 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CABP4P57796 275 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 TRIM5Q9C035 493 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 HMGXB3Q12766 1538 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 STK38Q15208 465 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TNS1-207ENST00000430930 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms