RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF15Q9NS87 1388 aa14.06□□□□□ -0.16
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC15A2Q16348 729 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HTRA3P83110 453 aa14.02□□□□□ -0.17
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.98□□□□□ -0.17
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHL34Q8N239 644 aa13.97□□□□□ -0.17
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PEAK1Q9H792 1746 aa13.95□□□□□ -0.18
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.93□□□□□ -0.18
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP19O94966 1318 aa13.92□□□□□ -0.18
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.89□□□□□ -0.19
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.84□□□□□ -0.19
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP35Q9P2H5 1018 aa13.83□□□□□ -0.2
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALS2Q96Q42 1657 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.8□□□□□ -0.2
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.8□□□□□ -0.2
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC37A3O60309 1634 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF827Q17R98 1081 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA0232Q92628 1395 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EVA1CP58658 441 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRNA2Q15822 529 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLTCL1P53675 1640 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD2APQ9Y5K6 639 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFT172Q9UG01 1749 aa13.7□□□□□ -0.22
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