RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BTG4Q9NY30 223 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ACEP12821 1306 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLEKHG5O94827 1062 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NRAPQ86VF7 1730 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLRP13Q86W25 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ABTB2Q8N961 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIAA0232Q92628 1395 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CPDO75976 1380 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP19O94966 1318 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EVC2Q86UK5 1308 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A0A0G2JS52 829 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYT1Q01538 1121 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CABP2Q9NPB3 220 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EVA1CP58658 441 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CABP1Q9NZU7 370 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GCP02774 474 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BAG6P46379 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BARGINQ6ZT62 677 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHRNA2Q15822 529 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NEUROD1Q13562 356 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EP400Q96L91 3159 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP6P35125 1406 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 STRN4Q9NRL3 753 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLRP6P59044 892 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SSH2Q76I76 1423 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DISP2A7MBM2 1401 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PDE3BQ13370 1112 aa22■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KCNH5Q8NCM2 988 aa22■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP35Q9P2H5 1018 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLIT3O75094 1523 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC24A1O60721 1099 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRB1P82279 1406 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM182BQ5T319 152 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TONSLQ96HA7 1378 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRIM37O94972 964 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.89■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 APBA3O96018 575 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIK3C2AO00443 1686 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP31Q70CQ4 1352 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AKAP12Q02952 1782 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL18A1P39060 1754 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDB1Q16531 1140 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms