RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCA3Q99758 1704 aa23.02■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATRNO75882 1429 aa23.01■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.01■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.01■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGS12O14924 1447 aa22.99■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLIT2O94813 1529 aa22.98■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CABP1Q9NZU7 370 aa22.98■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABTB2Q8N961 1025 aa22.97■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.96■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.96■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.96■■□□□ 1.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.95■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.95■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.95■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.94■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM83GA6ND36 823 aa22.94■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NLRP13Q86W25 1043 aa22.92■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP6P35125 1406 aa22.91■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VPS72Q15906 364 aa22.91■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BTG4Q9NY30 223 aa22.91■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.9■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.9■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC24A1O60721 1099 aa22.88■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA0232Q92628 1395 aa22.88■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A0G2JS52 829 aa22.87■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYT1Q01538 1121 aa22.87■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NLRP6P59044 892 aa22.86■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMC1Q8TDI8 760 aa22.86■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GLI3P10071 1580 aa22.85■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.84■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHRNA2Q15822 529 aa22.84■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP19O94966 1318 aa22.83■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.83■■□□□ 1.25
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRAPQ86VF7 1730 aa22.82■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EVA1CP58658 441 aa22.82■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STRN4Q9NRL3 753 aa22.82■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.82■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.81■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GCP02774 474 aa22.81■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.81■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP47Q96K76 1375 aa22.8■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.8■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKAP12Q02952 1782 aa22.8■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CPDO75976 1380 aa22.79■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.79■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSH2Q76I76 1423 aa22.78■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMF1P82094 1093 aa22.77■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIK3C2AO00443 1686 aa22.77■■□□□ 1.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.76■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TESK2Q96S53 571 aa22.76■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.76■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.76■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.75■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.75■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.74■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLIT3O75094 1523 aa22.74■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SOX12O15370 315 aa22.73■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.73■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDCA8Q53HL2 280 aa22.72■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP35Q9P2H5 1018 aa22.72■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC125Q86Z20 511 aa22.71■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.71■■□□□ 1.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.69■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.69■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.69■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1W2PP64 1363 aa22.69■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.69■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.68■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NME9Q86XW9 330 aa22.67■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP31Q70CQ4 1352 aa22.64■■□□□ 1.22
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.64■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.63■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.63■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.63■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRB1P82279 1406 aa22.63■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.62■■□□□ 1.21
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