RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC61Q9Y6R9 512 aa40.27■■■■■ 4.04
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TRIOBP-209ENST00000428075 VPS72Q15906 364 aa40.26■■■■■ 4.04
TRIOBP-209ENST00000428075 PLEKHG3A1L390 1219 aa40.25■■■■■ 4.03
TRIOBP-209ENST00000428075 EP400Q96L91 3159 aa40.25■■■■■ 4.03
TRIOBP-209ENST00000428075 ACEP12821 1306 aa40.24■■■■■ 4.03
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.23■■■■■ 4.03
TRIOBP-209ENST00000428075 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.21■■■■■ 4.03
TRIOBP-209ENST00000428075 QRICH2Q9H0J4 1663 aa40.18■■■■■ 4.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 CABP2Q9NPB3 220 aa40.17■■■■■ 4.02
TRIOBP-209ENST00000428075 BTG4Q9NY30 223 aa40.16■■■■■ 4.02
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TRIOBP-209ENST00000428075 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa40.12■■■■■ 4.01
TRIOBP-209ENST00000428075 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.12■■■■■ 4.01
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TRIOBP-209ENST00000428075 KRT27Q7Z3Y8 459 aa39.94■■■■□ 3.98
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TRIOBP-209ENST00000428075 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
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TRIOBP-209ENST00000428075 NLRP13Q86W25 1043 aa39.89■■■■□ 3.98
TRIOBP-209ENST00000428075 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa39.87■■■■□ 3.97
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TRIOBP-209ENST00000428075 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa39.86■■■■□ 3.97
TRIOBP-209ENST00000428075 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa39.86■■■■□ 3.97
TRIOBP-209ENST00000428075 TONSLQ96HA7 1378 aa39.85■■■■□ 3.97
TRIOBP-209ENST00000428075 STRN4Q9NRL3 753 aa39.85■■■■□ 3.97
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TRIOBP-209ENST00000428075 CARD11Q9BXL7 1154 aa39.83■■■■□ 3.97
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TRIOBP-209ENST00000428075 DEFB132Q7Z7B7 95 aa39.81■■■■□ 3.96
TRIOBP-209ENST00000428075 PIK3C2AO00443 1686 aa39.8■■■■□ 3.96
TRIOBP-209ENST00000428075 NLRP6P59044 892 aa39.79■■■■□ 3.96
TRIOBP-209ENST00000428075 SLIT3O75094 1523 aa39.78■■■■□ 3.96
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM182BQ5T319 152 aa39.77■■■■□ 3.96
TRIOBP-209ENST00000428075 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
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TRIOBP-209ENST00000428075 AKAP12Q02952 1782 aa39.76■■■■□ 3.96
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TRIOBP-209ENST00000428075 EVA1CP58658 441 aa39.74■■■■□ 3.95
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
TRIOBP-209ENST00000428075 USP35Q9P2H5 1018 aa39.72■■■■□ 3.95
TRIOBP-209ENST00000428075 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa39.72■■■■□ 3.95
TRIOBP-209ENST00000428075 ZRANB1Q9UGI0 708 aa39.7■■■■□ 3.95
TRIOBP-209ENST00000428075 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
TRIOBP-209ENST00000428075 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
TRIOBP-209ENST00000428075 BARGINQ6ZT62 677 aa39.68■■■■□ 3.94
TRIOBP-209ENST00000428075 AATKQ6ZMQ8 1374 aa39.66■■■■□ 3.94
TRIOBP-209ENST00000428075 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.65■■■■□ 3.94
TRIOBP-209ENST00000428075 TTC21AQ8NDW8 1320 aa39.65■■■■□ 3.94
TRIOBP-209ENST00000428075 COL18A1P39060 1754 aa39.64■■■■□ 3.94
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TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF25Q86VW2 580 aa39.59■■■■□ 3.93
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TRIOBP-209ENST00000428075 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.57■■■■□ 3.93
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TRIOBP-209ENST00000428075 KCNH5Q8NCM2 988 aa39.53■■■■□ 3.92
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TRIOBP-209ENST00000428075 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
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TRIOBP-209ENST00000428075 DISP2A7MBM2 1401 aa39.49■■■■□ 3.91
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