RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 KCNH2Q12809 1159 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 A6NJR5 290 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 LCE2BO14633 110 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 GPR37L1O60883 481 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-211ENST00000426951 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 PNMA1Q8ND90 353 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 IRF5Q13568 498 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 TRAK2O60296 914 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 ZNF787Q6DD87 383 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 WWC1Q8IX03 1113 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 LINC01559Q495D7 138 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 BAP1Q92560 729 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 NBPF14Q5TI25 921 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-211ENST00000426951 ARID3CA6NKF2 412 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 GFRA3O60609 400 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 VAC14Q08AM6 782 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 POM121CA8CG34 1229 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 TRIM32Q13049 653 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 WASHC4Q2M389 1173 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.059e-13■□□□□ 9.8
RBM39-211ENST00000426951 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 ZBBXA8MT70 800 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 FBXO45P0C2W1 286 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 SH3BP2P78314 561 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 AGERQ15109 404 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 ZNF511Q8NB15 262 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 FOXJ1Q92949 421 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 SLC19A1P41440 591 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 RPIAP49247 311 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 PTK2Q05397 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 NR1H3Q13133 447 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 SKOR1P84550 965 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB33Q86T24 672 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-211ENST00000426951 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 ADAM32Q8TC27 787 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 WNT7BP56706 349 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 SPRYD7Q5W111 196 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 GLMNQ92990 594 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 SEMA3FQ13275 785 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 ERFEQ4G0M1 354 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.41□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 ALG2Q9H553 416 aa8.41□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 SOX11P35716 441 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RBM39-211ENST00000426951 FOXC1Q12948 553 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 ARID5BQ14865 1188 aa8.38□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.38□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.38□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 ARID3AQ99856 593 aa8.38□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.38□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 WNT7AO00755 349 aa8.37□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.37□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 ZNF592Q92610 1267 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-211ENST00000426951 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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