RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 MNS1Q8NEH6 495 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT57Q9NWB7 429 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPK4P57078 832 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.288e-7■■■□□ 17.8
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 NFKBIBQ15653 356 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 MRE11P49959 708 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90B2PQ58FF3 399 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 CDR1P51861 262 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ACBD3Q9H3P7 528 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ASXL2Q76L83 1435 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 RUFY1Q96T51 708 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 AAMPQ13685 434 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC13BO14795 1591 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 NECTIN2Q92692 538 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 SDF4Q9BRK5 362 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ERC2O15083 957 aa13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD21O60216 631 aa13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP7D2Q96T17 732 aa13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 RUNDC1Q96C34 613 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAI1P63096 354 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF214Q8ND24 703 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ERICH2A1L162 156 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXW7Q969H0 707 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 AK7Q96M32 723 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 OFD1O75665 1012 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS37DQ86XT2 251 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC45O75419 566 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3O95983 291 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 DEPDC5O75140 1603 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAK2O60296 914 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 EVA1CP58658 441 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 PANK1Q8TE04 598 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 FOSBP53539 338 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 OLFM4Q6UX06 510 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM5Q9C035 493 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.21□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROD6Q96NK8 337 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCP20941 246 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 WASHC4Q2M389 1173 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YHG0 523 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PDILTQ8N807 584 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO3Q9UK99 471 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM5CP41229 1560 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 KINO60870 393 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMA5P28066 241 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 ODF2Q5BJF6 829 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK4P51957 841 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM2P49736 904 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms