RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416506.5

PCBP1-AS1-211, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCBP1-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.82□□□□□ -1.64
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.82□□□□□ -1.64
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PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IDI1Q13907 227 aa4.73□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ADGRB2O60241 1585 aa4.73□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.72□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 USP47Q96K76 1375 aa4.72□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.72□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LTN1O94822 1766 aa4.72□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 USP32Q8NFA0 1604 aa4.72□□□□□ -1.65
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIF1AQ12756 1690 aa4.71□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa4.71□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NBPF8Q3BBV2 869 aa4.71□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NBPF3Q9H094 633 aa4.71□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MED14O60244 1454 aa4.7□□□□□ -1.66
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LMTK3Q96Q04 1460 aa4.7□□□□□ -1.66
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