RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 ABCC11Q96J66 1382 aa26.68■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 GSE1Q14687 1217 aa26.68■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.68■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 SHPRHQ149N8 1683 aa26.68■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.67■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 C8orf34Q49A92 452 aa26.67■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.67■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.67■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 PRKAR2BP31323 418 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 WDR63Q8IWG1 891 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.66■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 FAM161AQ3B820 660 aa26.65■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 PDE3AQ14432 1141 aa26.65■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.64■■□□□ 1.86
SPRN-201ENST00000414069 METP08581 1390 aa26.63■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.63■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 ALKQ9UM73 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 PLEKHG5O94827 1062 aa26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 POLKQ9UBT6 870 aa26.62■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.61■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 NGEFQ8N5V2 710 aa26.61■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 USP35Q9P2H5 1018 aa26.61■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 SEC24BO95487 1268 aa26.6■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.6■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.58■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SPRN-201ENST00000414069 NSD2O96028 1365 aa26.57■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 ZFYVE9O95405 1425 aa26.57■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 DIP2BQ9P265 1576 aa26.57■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.57■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 ZMYM3Q14202 1370 aa26.57■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 ZMYND15Q9H091 742 aa26.56■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 DCTN1Q14203 1278 aa26.56■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.56■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 TRIM27P14373 513 aa26.54■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 FAM83GA6ND36 823 aa26.54■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.53■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.53■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 NFKBIBQ15653 356 aa26.53■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 CCDC27Q2M243 656 aa26.53■■□□□ 1.84
SPRN-201ENST00000414069 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.51■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.5■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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SPRN-201ENST00000414069 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.48■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 TSPYL6Q8N831 410 aa26.48■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 COG3Q96JB2 828 aa26.48■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 ARXQ96QS3 562 aa26.48■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.47■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 LTKP29376 864 aa26.47■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 NLRP1Q9C000 1473 aa26.47■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.46■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.45■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.45■■□□□ 1.83
SPRN-201ENST00000414069 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.45■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.45■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.44■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.43■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 FCHSD2O94868 740 aa26.43■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.42■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.41■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 USP32Q8NFA0 1604 aa26.4■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 KRT24Q2M2I5 525 aa26.4■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.39■■□□□ 1.82
SPRN-201ENST00000414069 TNRQ92752 1358 aa26.39■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.38■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 IL13P35225 146 aa26.37■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 NFE2L2Q16236 605 aa26.37■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.37■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.37■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.35■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 ACEP12821 1306 aa26.35■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 MBIPQ9NS73 344 aa26.34■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 LNPKQ9C0E8 428 aa26.34■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.34■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.33■■□□□ 1.81
SPRN-201ENST00000414069 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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