RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 ACEP12821 1306 aa39.81■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PLCH1Q4KWH8 1693 aa39.8■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 VPS72Q15906 364 aa39.8■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM83GA6ND36 823 aa39.79■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.79■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GLI3P10071 1580 aa39.78■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.78■■■■□ 3.96
ANKRD54-203ENST00000407117 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa39.74■■■■□ 3.95
ANKRD54-203ENST00000407117 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa39.73■■■■□ 3.95
ANKRD54-203ENST00000407117 CABP2Q9NPB3 220 aa39.72■■■■□ 3.95
ANKRD54-203ENST00000407117 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
ANKRD54-203ENST00000407117 EVC2Q86UK5 1308 aa39.68■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 BTG4Q9NY30 223 aa39.68■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 PRDM11Q9NQV5 511 aa39.65■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 NRAPQ86VF7 1730 aa39.65■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 TONSLQ96HA7 1378 aa39.64■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
ANKRD54-203ENST00000407117 ABTB2Q8N961 1025 aa39.61■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 SEPT12Q8IYM1 358 aa39.6■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 CABP1Q9NZU7 370 aa39.6■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM2GQ5VZR2 741 aa39.59■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC125Q86Z20 511 aa39.59■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA0232Q92628 1395 aa39.59■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 EP400Q96L91 3159 aa39.58■■■■□ 3.93
ANKRD54-203ENST00000407117 USP19O94966 1318 aa39.55■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 USP6P35125 1406 aa39.55■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 NLRP13Q86W25 1043 aa39.54■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 CARD11Q9BXL7 1154 aa39.54■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa39.54■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa39.51■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa39.51■■■■□ 3.92
ANKRD54-203ENST00000407117 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.5■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 BRWD3Q6RI45 1802 aa39.49■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 CPDO75976 1380 aa39.48■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 CHRNA2Q15822 529 aa39.48■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 KRT27Q7Z3Y8 459 aa39.47■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 SSH2Q76I76 1423 aa39.46■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A0G2JS52 829 aa39.45■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 MYT1Q01538 1121 aa39.45■■■■□ 3.91
ANKRD54-203ENST00000407117 GCP02774 474 aa39.44■■■■□ 3.9
ANKRD54-203ENST00000407117 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
ANKRD54-203ENST00000407117 NLRP6P59044 892 aa39.4■■■■□ 3.9
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa39.4■■■■□ 3.9
ANKRD54-203ENST00000407117 STRN4Q9NRL3 753 aa39.39■■■■□ 3.9
ANKRD54-203ENST00000407117 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 SLIT3O75094 1523 aa39.35■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 EVA1CP58658 441 aa39.35■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 LMO7Q8WWI1 1683 aa39.35■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa39.35■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa39.35■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa39.34■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 TTC21AQ8NDW8 1320 aa39.33■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 AKAP12Q02952 1782 aa39.33■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 PIK3C2AO00443 1686 aa39.32■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
ANKRD54-203ENST00000407117 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
ANKRD54-203ENST00000407117 BARGINQ6ZT62 677 aa39.27■■■■□ 3.88
ANKRD54-203ENST00000407117 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
ANKRD54-203ENST00000407117 AATKQ6ZMQ8 1374 aa39.26■■■■□ 3.88
ANKRD54-203ENST00000407117 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNH5Q8NCM2 988 aa39.24■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 ZRANB1Q9UGI0 708 aa39.24■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC24A1O60721 1099 aa39.23■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 USP35Q9P2H5 1018 aa39.23■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 TCP11L2Q8N4U5 519 aa39.21■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 MON2Q7Z3U7 1717 aa39.2■■■■□ 3.87
ANKRD54-203ENST00000407117 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.18■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ZBTB7CA1YPR0 619 aa39.18■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 DEFB132Q7Z7B7 95 aa39.18■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 TMC1Q8TDI8 760 aa39.18■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 TESK2Q96S53 571 aa39.17■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CRB1P82279 1406 aa39.16■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa39.16■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF25Q86VW2 580 aa39.15■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 BAG6P46379 1132 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM182BQ5T319 152 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 TERF2IPQ9NYB0 399 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD54-203ENST00000407117 USP31Q70CQ4 1352 aa39.13■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.12■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.11■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 COL18A1P39060 1754 aa39.11■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM196AQ6ZSG2 479 aa39.11■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 RGPD1P0DJD0 1748 aa39.09■■■■□ 3.85
ANKRD54-203ENST00000407117 PDE3BQ13370 1112 aa39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms