RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

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Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.21■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.21■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.2■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.2■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 MYOM2P54296 1465 aa27.19■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.19■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 PDLIM2Q96JY6 352 aa27.18■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 KIF16BQ96L93 1317 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 CFAP53Q96M91 514 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 NOS1P29475 1434 aa27.14■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.14■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 TET3O43151 1660 aa27.14■■□□□ 1.94
CLDN5-201ENST00000403084 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 LNPKQ9C0E8 428 aa27.14■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 MTHFSP49914 203 aa27.13■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.13■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 DEPDC5O75140 1603 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 UQCRHLA0A096LP55 91 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 UQCRHP07919 91 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 IFT172Q9UG01 1749 aa27.1■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 ABCC11Q96J66 1382 aa27.1■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 DYNC1I1O14576 645 aa27.1■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.1■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 MCM5P33992 734 aa27.09■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.09■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 REREQ9P2R6 1566 aa27.09■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 RBSNQ9H1K0 784 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN5-201ENST00000403084 AK9Q5TCS8 1911 aa27.07■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.07■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 LMBRD1Q9NUN5 540 aa27.06■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 NUCB2P80303 420 aa27.05■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 IL16Q14005 1332 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 CD109Q6YHK3 1445 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 MCTP1Q6DN14 999 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 PLCH2O75038 1416 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 MED14O60244 1454 aa27.04■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 ABCC1P33527 1531 aa27.03■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.03■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 GCC1Q96CN9 775 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.02■■□□□ 1.92
CLDN5-201ENST00000403084 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 KIF1BO60333 1816 aa27.01■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 NSD2O96028 1365 aa27■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.99■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.99■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 RABEP1Q15276 862 aa26.99■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.97■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 CDC45O75419 566 aa26.97■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN5-201ENST00000403084 MROH2AA6NES4 1674 aa26.94■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.94■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.94■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.93■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 GPT2Q8TD30 523 aa26.93■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.92■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CLDN5-201ENST00000403084 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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