RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395925.7

GLI3-201, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GLI3, Length 8,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-201ENST00000395925 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 LNPKQ9C0E8 428 aa14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 EVC2Q86UK5 1308 aa14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 RIPK4P57078 832 aa14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 CFAP45Q9UL16 551 aa14.64□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 KINO60870 393 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 ATP2B2Q01814 1243 aa14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.63□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 ERLIN1O75477 346 aa14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.62□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 POTEJP0CG39 1038 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 FAM177BA6PVY3 158 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 FAM193AP78312 1265 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 APAF1O14727 1248 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 SPC24Q8NBT2 197 aa14.61□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 PSMA5P28066 241 aa14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 PSMD1Q99460 953 aa14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 DRC1Q96MC2 740 aa14.6□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 CETN2P41208 172 aa14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 SOGA3Q5TF21 947 aa14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 CNTROBQ8N137 903 aa14.59□□□□□ -0.07
GLI3-201ENST00000395925 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 HMOX1P09601 288 aa14.58□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.58□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 FMN1Q68DA7 1419 aa14.58□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 TICAM2Q86XR7 235 aa14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 TIGD1Q96MW7 591 aa14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 FSD1Q9BTV5 496 aa14.57□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 FERP16591 822 aa14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 SERPINC1P01008 464 aa14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 CBX1P83916 185 aa14.56□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 UACAQ9BZF9 1416 aa14.55□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.55□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 DACH1Q9UI36 760 aa14.55□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.54□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 DAAM2Q86T65 1068 aa14.54□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 HOOK3Q86VS8 718 aa14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 DDX11Q96FC9 970 aa14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 UBE4AQ14139 1066 aa14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 TSPY26PQ9H489 355 aa14.53□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 PRDM2Q13029 1718 aa14.52□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.52□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 KIAA1328Q86T90 577 aa14.52□□□□□ -0.08
GLI3-201ENST00000395925 FIBPO43427 364 aa14.52□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.52□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 JMYQ8N9B5 988 aa14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 ATF3P18847 181 aa14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 STK38Q15208 465 aa14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.51□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 PDCP20941 246 aa14.5□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.5□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GLI3-201ENST00000395925 MYZAPP0CAP1 466 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms