RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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PTPRK-208ENST00000392449 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
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PTPRK-208ENST00000392449 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-208ENST00000392449 BTG4Q9NY30 223 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-208ENST00000392449 ACEP12821 1306 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRK-208ENST00000392449 CCDC125Q86Z20 511 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRK-208ENST00000392449 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRK-208ENST00000392449 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRK-208ENST00000392449 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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PTPRK-208ENST00000392449 ABTB2Q8N961 1025 aa23.83■■□□□ 1.41
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PTPRK-208ENST00000392449 CABP1Q9NZU7 370 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRK-208ENST00000392449 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.8■■□□□ 1.4
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PTPRK-208ENST00000392449 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-208ENST00000392449 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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PTPRK-208ENST00000392449 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRK-208ENST00000392449 COL18A1P39060 1754 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRK-208ENST00000392449 SOX12O15370 315 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRK-208ENST00000392449 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-208ENST00000392449 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-208ENST00000392449 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTPRK-208ENST00000392449 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-208ENST00000392449 RGPD5Q99666 1765 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-208ENST00000392449 CRB1P82279 1406 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRK-208ENST00000392449 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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PTPRK-208ENST00000392449 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 NFAT5O94916 1531 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 DISP2A7MBM2 1401 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 TMC1Q8TDI8 760 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-208ENST00000392449 LRRC37A3O60309 1634 aa23.53■■□□□ 1.36
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