RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389398.9

VWA3A-202, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene VWA3A, Length 4,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-202ENST00000389398 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 A0A1B0GUA9 196 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 LMAN1P49257 510 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 GOLIM4O00461 696 aa9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 ERLIN2O94905 339 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 PTPN14Q15678 1187 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 GBP6Q6ZN66 633 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 NGLY1Q96IV0 654 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SDF4Q9BRK5 362 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SPATA24Q86W54 205 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.5□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 A0A1B0GUL7 405 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SMC2O95347 1197 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 ODF2Q5BJF6 829 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 PSMD1Q99460 953 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 CD109Q6YHK3 1445 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SMARCE1Q969G3 411 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 FEZ1Q99689 392 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 OLFM4Q6UX06 510 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SWAP70Q9UH65 585 aa9.49□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 MAP9Q49MG5 647 aa9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 TOPBP1Q92547 1522 aa9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 IQCEQ6IPM2 695 aa9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 COG6Q9Y2V7 657 aa9.48□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 MORC1Q86VD1 984 aa9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 CFTRP13569 1480 aa9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 SEPT6Q14141 434 aa9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 MCM2P49736 904 aa9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.46□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 KINO60870 393 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.46□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.46□□□□□ -0.89
VWA3A-202ENST00000389398 OFD1O75665 1012 aa9.46□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 MCM3P25205 808 aa9.46□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.46□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 FBXW7Q969H0 707 aa9.46□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.46□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 RILPL2Q969X0 211 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 OGFRQ9NZT2 677 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 SYNJ2O15056 1496 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ADAMTS2O95450 1211 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 HSPA4P34932 840 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 CFAP45Q9UL16 551 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 MAP2K2P36507 400 aa9.44□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 POTEB2H3BUK9 544 aa9.43□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 IGSF3O75054 1194 aa9.43□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC181Q5TID7 509 aa9.43□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.43□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 ATP6V1AP38606 617 aa9.43□□□□□ -0.9
VWA3A-202ENST00000389398 CEP57Q86XR8 500 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms