RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 SSH2Q76I76 1423 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 MORC1Q86VD1 984 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.62■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 NLRP13Q86W25 1043 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 SLAIN2Q9P270 581 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 PSME1Q06323 249 aa25.59■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 NME9Q86XW9 330 aa25.58■■□□□ 1.69
PRRT1-202ENST00000375150 FOXO3O43524 673 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 PPP2R1AP30153 589 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 MRS2Q9HD23 443 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 COG3Q96JB2 828 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 PIK3C2AO00443 1686 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.53■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 BRINP3Q76B58 766 aa25.53■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PRRT1-202ENST00000375150 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.51■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.51■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC184Q52MB2 194 aa25.51■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 USP54Q70EL1 1684 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 USP31Q70CQ4 1352 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.49■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 ABTB2Q8N961 1025 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.47■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 PXDNQ92626 1479 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 SBNO1A3KN83 1393 aa25.45■■□□□ 1.67
PRRT1-202ENST00000375150 NLRP6P59044 892 aa25.45■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 ALS2Q96Q42 1657 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.43■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 TOM1O60784 492 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 MTHFSP49914 203 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 CFAP53Q96M91 514 aa25.4■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.4■■□□□ 1.66
PRRT1-202ENST00000375150 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.39■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.37■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGEF10O15013 1369 aa25.37■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 POLKQ9UBT6 870 aa25.36■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.36■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 CERKQ8TCT0 537 aa25.34■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 SLIT3O75094 1523 aa25.34■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 SOX12O15370 315 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 FBLN1P23142 703 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 USP19O94966 1318 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-202ENST00000375150 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 NFAT5O94916 1531 aa25.31■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 INSRP06213 1382 aa25.31■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.31■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 SHPRHQ149N8 1683 aa25.3■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 LTN1O94822 1766 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 PIP4K2BP78356 416 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 PEAK1Q9H792 1746 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRT1-202ENST00000375150 PHLPP1O60346 1717 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 GCP02774 474 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 FLT4P35916 1363 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 NUDCQ9Y266 331 aa25.25■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 RTL1A6NKG5 1358 aa25.24■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 AMPHP49418 695 aa25.23■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHG5O94827 1062 aa25.23■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PRRT1-202ENST00000375150 ABCA3Q99758 1704 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 HOXC9P31274 260 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-202ENST00000375150 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
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