RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 FAM83GA6ND36 823 aa20.4■□□□□ 0.86
CITED1-202ENST00000373619 NRAPQ86VF7 1730 aa20.39■□□□□ 0.86
CITED1-202ENST00000373619 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 BTG4Q9NY30 223 aa20.39■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.37■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.36■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.35■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 BAG6P46379 1132 aa20.34■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 ATP7BP35670 1465 aa20.34■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.33■□□□□ 0.85
CITED1-202ENST00000373619 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.33■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.31■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 CDK19Q9BWU1 502 aa20.31■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.29■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.29■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED1-202ENST00000373619 EVA1CP58658 441 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 KIAA0232Q92628 1395 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 STRN4Q9NRL3 753 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 ACEP12821 1306 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 ABTB2Q8N961 1025 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.22■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 LRP5O75197 1615 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 CHRNA2Q15822 529 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 NLRP13Q86W25 1043 aa20.21■□□□□ 0.83
CITED1-202ENST00000373619 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 PDE3BQ13370 1112 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 USP35Q9P2H5 1018 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 FAM182BQ5T319 152 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 BARGINQ6ZT62 677 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 CPDO75976 1380 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 SSH2Q76I76 1423 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 DISP2A7MBM2 1401 aa20.15■□□□□ 0.82
CITED1-202ENST00000373619 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.14■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.14■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.13■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 USP19O94966 1318 aa20.13■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 CABP2Q9NPB3 220 aa20.13■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 EVC2Q86UK5 1308 aa20.12■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 TRIM37O94972 964 aa20.12■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 GCP02774 474 aa20.12■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.12■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.11■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 APBA3O96018 575 aa20.11■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.09■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 NLRP6P59044 892 aa20.09■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 CABP1Q9NZU7 370 aa20.08■□□□□ 0.81
CITED1-202ENST00000373619 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.08■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 USP6P35125 1406 aa20.08■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 NBPF14Q5TI25 921 aa20.07■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 CRB1P82279 1406 aa20.07■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 SLIT3O75094 1523 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 RREB1Q92766 1687 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 AKAP12Q02952 1782 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED1-202ENST00000373619 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.02■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.02■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.02■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 PIK3C2AO00443 1686 aa20.01■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 NEUROD1Q13562 356 aa20.01■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.99■□□□□ 0.79
CITED1-202ENST00000373619 DDB1Q16531 1140 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms