RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366988.4

NENF-201, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NENF, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-201ENST00000366988 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
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NENF-201ENST00000366988 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.74■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.73■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.73■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.72■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 ATRNO75882 1429 aa28.72■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 SLIT2O94813 1529 aa28.71■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 CABP1Q9NZU7 370 aa28.71■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.7■■■□□ 2.19
NENF-201ENST00000366988 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.68■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.68■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 RGS12O14924 1447 aa28.68■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.67■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.66■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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NENF-201ENST00000366988 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 ABTB2Q8N961 1025 aa28.65■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 USP6P35125 1406 aa28.64■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 AKAP12Q02952 1782 aa28.64■■■□□ 2.18
NENF-201ENST00000366988 FAM83GA6ND36 823 aa28.63■■■□□ 2.17
NENF-201ENST00000366988 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
NENF-201ENST00000366988 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.59■■■□□ 2.17
NENF-201ENST00000366988 NRAPQ86VF7 1730 aa28.59■■■□□ 2.17
NENF-201ENST00000366988 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.58■■■□□ 2.17
NENF-201ENST00000366988 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.58■■■□□ 2.17
NENF-201ENST00000366988 NLRP13Q86W25 1043 aa28.57■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 GLI3P10071 1580 aa28.57■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 USP47Q96K76 1375 aa28.56■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 BTG4Q9NY30 223 aa28.56■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 KIAA0232Q92628 1395 aa28.55■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 VPS72Q15906 364 aa28.55■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 PIK3C2AO00443 1686 aa28.54■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 USP19O94966 1318 aa28.54■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 SLC24A1O60721 1099 aa28.54■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.54■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 SSH2Q76I76 1423 aa28.53■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 TMC1Q8TDI8 760 aa28.53■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 TESK2Q96S53 571 aa28.53■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
NENF-201ENST00000366988 NLRP6P59044 892 aa28.51■■■□□ 2.15
NENF-201ENST00000366988 CHRNA2Q15822 529 aa28.5■■■□□ 2.15
NENF-201ENST00000366988 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
NENF-201ENST00000366988 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.49■■■□□ 2.15
NENF-201ENST00000366988 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.48■■■□□ 2.15
NENF-201ENST00000366988 GCP02774 474 aa28.47■■■□□ 2.15
NENF-201ENST00000366988 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
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NENF-201ENST00000366988 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.46■■■□□ 2.15
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NENF-201ENST00000366988 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.44■■■□□ 2.14
NENF-201ENST00000366988 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.43■■■□□ 2.14
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NENF-201ENST00000366988 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.42■■■□□ 2.14
NENF-201ENST00000366988 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
NENF-201ENST00000366988 A0A1W2PP64 1363 aa28.4■■■□□ 2.14
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NENF-201ENST00000366988 MYT1Q01538 1121 aa28.4■■■□□ 2.14
NENF-201ENST00000366988 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.4■■■□□ 2.14
NENF-201ENST00000366988 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.4■■■□□ 2.14
NENF-201ENST00000366988 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.4■■■□□ 2.14
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NENF-201ENST00000366988 USP54Q70EL1 1684 aa28.36■■■□□ 2.13
NENF-201ENST00000366988 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
NENF-201ENST00000366988 CDCA8Q53HL2 280 aa28.36■■■□□ 2.13
NENF-201ENST00000366988 SOX12O15370 315 aa28.35■■■□□ 2.13
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NENF-201ENST00000366988 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.33■■■□□ 2.13
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NENF-201ENST00000366988 USP31Q70CQ4 1352 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 NFAT5O94916 1531 aa28.31■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 COL18A1P39060 1754 aa28.3■■■□□ 2.12
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NENF-201ENST00000366988 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 USP35Q9P2H5 1018 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 RGPD5Q99666 1765 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 EP400Q96L91 3159 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-201ENST00000366988 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.112e-7■■■■■ 36.9
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