RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 GNAI3P08754 354 aa25.49■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.49■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 SLC4A2P04920 1241 aa25.49■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.49■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 TPM1P09493 284 aa25.47■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.47■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.46■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 NUCB2P80303 420 aa25.46■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF592Q92610 1267 aa25.45■■□□□ 1.67
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 MTMR7Q9Y216 660 aa25.45■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF11O15085 1522 aa25.44■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 PDE3AQ14432 1141 aa25.43■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.43■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 GNAI2P04899 355 aa25.43■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.43■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.42■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 CABP4P57796 275 aa25.41■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 WWC1Q8IX03 1113 aa25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.4■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SMURF1-201ENST00000361125 MRE11P49959 708 aa25.39■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 PSMA5P28066 241 aa25.39■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 MYL6BP14649 208 aa25.38■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 SIL1Q9H173 461 aa25.38■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 IQGAP2Q13576 1575 aa25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 IL27Q8NEV9 243 aa25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 TRAK2O60296 914 aa25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.37■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.36■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 GCC1Q96CN9 775 aa25.36■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.36■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K1Q13233 1512 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 WDR63Q8IWG1 891 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.35■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.34■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 NEK4P51957 841 aa25.34■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.33■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.33■■□□□ 1.65
SMURF1-201ENST00000361125 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.32■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.32■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 SPG7Q9UQ90 795 aa25.32■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.31■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.31■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.3■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 BTBD11A6QL63 1104 aa25.29■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 HOMER1Q86YM7 354 aa25.29■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.29■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.28■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.28■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 HIP1O00291 1037 aa25.27■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.27■■□□□ 1.64
SMURF1-201ENST00000361125 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.26■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 XBP1P17861 261 aa25.25■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2B1P20020 1258 aa25.24■■□□□ 1.63
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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