RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ABCA3Q99758 1704 aa38.08■■■■□ 3.69
TPGS1-201ENST00000359315 USP6P35125 1406 aa38.06■■■■□ 3.68
TPGS1-201ENST00000359315 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
TPGS1-201ENST00000359315 NUTM2GQ5VZR2 741 aa38.06■■■■□ 3.68
TPGS1-201ENST00000359315 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
TPGS1-201ENST00000359315 USP21Q9UK80 565 aa38■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 SSH2Q76I76 1423 aa38■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.99■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 BCL9LQ86UU0 1499 aa37.98■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 CD163L1Q9NR16 1453 aa37.97■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 ABTB2Q8N961 1025 aa37.96■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLIT2O94813 1529 aa37.96■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa37.95■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
TPGS1-201ENST00000359315 SOCS7O14512 581 aa37.94■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 TMC1Q8TDI8 760 aa37.94■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 FAM83GA6ND36 823 aa37.92■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 ATRNO75882 1429 aa37.91■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 USP19O94966 1318 aa37.9■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 RXRBP28702 533 aa37.9■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.89■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 AKAP12Q02952 1782 aa37.89■■■■□ 3.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
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TPGS1-201ENST00000359315 TMF1P82094 1093 aa37.88■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3C2AO00443 1686 aa37.85■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PP64 1363 aa37.84■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0232Q92628 1395 aa37.84■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 SLC24A1O60721 1099 aa37.84■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 UNC5CLQ8IV45 518 aa37.84■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 PLCH1Q4KWH8 1693 aa37.84■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP13Q86W25 1043 aa37.83■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 MON2Q7Z3U7 1717 aa37.82■■■■□ 3.65
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP6P59044 892 aa37.82■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 RGS12O14924 1447 aa37.81■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.8■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNA2Q15822 529 aa37.79■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 TTC21AQ8NDW8 1320 aa37.78■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 GCP02774 474 aa37.77■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 BTG4Q9NY30 223 aa37.77■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.77■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 NINLQ9Y2I6 1382 aa37.77■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 SLIT3O75094 1523 aa37.77■■■■□ 3.64
TPGS1-201ENST00000359315 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
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TPGS1-201ENST00000359315 NME9Q86XW9 330 aa37.74■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 NRAPQ86VF7 1730 aa37.73■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 NWD2Q9ULI1 1742 aa37.73■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 GLI3P10071 1580 aa37.72■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 CPDO75976 1380 aa37.71■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 VPS72Q15906 364 aa37.7■■■■□ 3.63
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa37.69■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 CDCA8Q53HL2 280 aa37.68■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 SOX12O15370 315 aa37.66■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 USP31Q70CQ4 1352 aa37.66■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB7CA1YPR0 619 aa37.64■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 MYOM1P52179 1685 aa37.63■■■■□ 3.62
TPGS1-201ENST00000359315 LMO7Q8WWI1 1683 aa37.62■■■■□ 3.61
TPGS1-201ENST00000359315 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa37.62■■■■□ 3.61
TPGS1-201ENST00000359315 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.6■■■■□ 3.61
TPGS1-201ENST00000359315 STRN4Q9NRL3 753 aa37.6■■■■□ 3.61
TPGS1-201ENST00000359315 NFAT5O94916 1531 aa37.6■■■■□ 3.61
TPGS1-201ENST00000359315 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa37.59■■■■□ 3.61
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TPGS1-201ENST00000359315 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 USP54Q70EL1 1684 aa37.56■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 KCNH5Q8NCM2 988 aa37.56■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF25Q86VW2 580 aa37.55■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa37.55■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa37.55■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 AATKQ6ZMQ8 1374 aa37.55■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 CARD14Q9BXL6 1004 aa37.53■■■■□ 3.6
TPGS1-201ENST00000359315 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
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TPGS1-201ENST00000359315 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa37.48■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 EVA1CP58658 441 aa37.48■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 SEPT12Q8IYM1 358 aa37.48■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 COL18A1P39060 1754 aa37.47■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 NSD3Q9BZ95 1437 aa37.47■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
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