RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCOA1Q15788 1441 aa9.1□□□□□ -0.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USTQ9Y2C2 406 aa9.09□□□□□ -0.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.09□□□□□ -0.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.09□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ROCK1Q13464 1354 aa9.08□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HAX1O00165 279 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF3BO15066 747 aa9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCC1P33527 1531 aa9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.06□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUP155O75694 1391 aa9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE4CQ08493 712 aa9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GGT6Q6P531 493 aa9.05□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MLECQ14165 292 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 QPCTQ16769 361 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EVI5O60447 810 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR37L1O60883 481 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEO1Q92859 1461 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRL2O95490 1459 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDCA8Q53HL2 280 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP7AQ04656 1500 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VRTNQ9H8Y1 702 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UCN2Q96RP3 112 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP3K7O43318 606 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCL11AQ9H165 835 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RICTORQ6R327 1708 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WWC1Q8IX03 1113 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AP1G2O75843 785 aa8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KANK1Q14678 1352 aa8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OCEL1Q9H607 264 aa8.97□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L8P0C7I0 530 aa8.96□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A2MP01023 1474 aa8.96□□□□□ -0.97
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.96□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POTEFA5A3E0 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VAC14Q08AM6 782 aa8.96□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.96□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.95□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERBINQ96RT1 1412 aa8.95□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TONSLQ96HA7 1378 aa8.95□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.95□□□□□ -0.98
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms