RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RICTORQ6R327 1708 aa21.14■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 RLBP1P12271 317 aa21.14■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 HSCBQ8IWL3 235 aa21.14■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.12■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 EVC2Q86UK5 1308 aa21.11■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 PIK3C2BO00750 1634 aa21.1■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.1■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 MTHFSP49914 203 aa21.09■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.09■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 AAMPQ13685 434 aa21.09■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 WWC1Q8IX03 1113 aa21.09■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 DDIT3P35638 169 aa21.08■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.08■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.08■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.07■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.06■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.06■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 RIPK4P57078 832 aa21.06■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.06■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 OFD1O75665 1012 aa21.05■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.05■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 NGEFQ8N5V2 710 aa21.05■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.05■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 GBP4Q96PP9 640 aa21.05■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 TSPOAP1O95153 1857 aa21.04■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.03■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.03■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 SHPRHQ149N8 1683 aa21.03■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.02■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHG5O94827 1062 aa21.02■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 MLECQ14165 292 aa21.02■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 PRAM1Q96QH2 718 aa21.02■□□□□ 0.96
GDE1-201ENST00000353258 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.01■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.01■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 MSNP26038 577 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 RUNDC1Q96C34 613 aa21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 RAB3GAP1Q15042 981 aa21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 FAM13BQ9NYF5 915 aa21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 SMC5Q8IY18 1101 aa21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 CFAP53Q96M91 514 aa21■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PP64 1363 aa20.98■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.98■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 SNX21Q969T3 373 aa20.97■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 TERF1P54274 439 aa20.96■□□□□ 0.95
GDE1-201ENST00000353258 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.95■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 PTMSP20962 102 aa20.94■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 ZFYVE9O95405 1425 aa20.94■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 MAP7D2Q96T17 732 aa20.94■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 USP32Q8NFA0 1604 aa20.94■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 PTPRMP28827 1452 aa20.93■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 ARID3AQ99856 593 aa20.91■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.9■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.9■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.9■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.9■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.9■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 CDK19Q9BWU1 502 aa20.9■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 SSFA2P28290 1259 aa20.89■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 DIP2BQ9P265 1576 aa20.89■□□□□ 0.94
GDE1-201ENST00000353258 NSD2O96028 1365 aa20.89■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 ABCC11Q96J66 1382 aa20.89■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.89■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 FYB1O15117 783 aa20.89■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 UQCRHP07919 91 aa20.89■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.88■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 CABP1Q9NZU7 370 aa20.88■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.88■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.88■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
GDE1-201ENST00000353258 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms