RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 MYT1Q01538 1121 aa36.46■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 BTG4Q9NY30 223 aa36.45■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.45■■■■□ 3.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP7BP35670 1465 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.42■■■■□ 3.42
PPP4R4-202ENST00000328839 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.4■■■■□ 3.42
PPP4R4-202ENST00000328839 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
PPP4R4-202ENST00000328839 CDK19Q9BWU1 502 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
PPP4R4-202ENST00000328839 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.35■■■■□ 3.41
PPP4R4-202ENST00000328839 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.35■■■■□ 3.41
PPP4R4-202ENST00000328839 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.34■■■■□ 3.41
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PPP4R4-202ENST00000328839 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.29■■■■□ 3.4
PPP4R4-202ENST00000328839 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP4R4-202ENST00000328839 ACEP12821 1306 aa36.27■■■■□ 3.4
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA0232Q92628 1395 aa36.27■■■■□ 3.4
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.26■■■■□ 3.4
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.26■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.26■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 CHRNA2Q15822 529 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.22■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.2■■■■□ 3.39
PPP4R4-202ENST00000328839 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
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PPP4R4-202ENST00000328839 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.19■■■■□ 3.38
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PPP4R4-202ENST00000328839 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.18■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.18■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM182BQ5T319 152 aa36.18■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 BAG6P46379 1132 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 ABTB2Q8N961 1025 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.16■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.15■■■■□ 3.38
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.13■■■■□ 3.37
PPP4R4-202ENST00000328839 CABP2Q9NPB3 220 aa36.13■■■■□ 3.37
PPP4R4-202ENST00000328839 EVA1CP58658 441 aa36.1■■■■□ 3.37
PPP4R4-202ENST00000328839 USP35Q9P2H5 1018 aa36.1■■■■□ 3.37
PPP4R4-202ENST00000328839 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4R4-202ENST00000328839 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 SSH2Q76I76 1423 aa36.06■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP13Q86W25 1043 aa36.04■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.04■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 USP19O94966 1318 aa36.04■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.03■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.03■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.01■■■■□ 3.36
PPP4R4-202ENST00000328839 CPDO75976 1380 aa36.01■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 CABP1Q9NZU7 370 aa36■■■■□ 3.35
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PPP4R4-202ENST00000328839 NEUROD1Q13562 356 aa35.98■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.97■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 USP6P35125 1406 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 LRP5O75197 1615 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 EVC2Q86UK5 1308 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM37O94972 964 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 BARGINQ6ZT62 677 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE3BQ13370 1112 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 DISP2A7MBM2 1401 aa35.93■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP6P59044 892 aa35.93■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.93■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 PIK3C2AO00443 1686 aa35.9■■■■□ 3.34
PPP4R4-202ENST00000328839 SLIT3O75094 1523 aa35.87■■■■□ 3.33
PPP4R4-202ENST00000328839 APBA3O96018 575 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP4R4-202ENST00000328839 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
PPP4R4-202ENST00000328839 AKAP12Q02952 1782 aa35.85■■■■□ 3.33
PPP4R4-202ENST00000328839 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PPP4R4-202ENST00000328839 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PPP4R4-202ENST00000328839 CRB1P82279 1406 aa35.83■■■■□ 3.33
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PPP4R4-202ENST00000328839 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4R4-202ENST00000328839 COL18A1P39060 1754 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP4R4-202ENST00000328839 RREB1Q92766 1687 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP4R4-202ENST00000328839 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
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PPP4R4-202ENST00000328839 SOX12O15370 315 aa35.75■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.75■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.74■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC37A3O60309 1634 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP4R4-202ENST00000328839 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.69■■■■□ 3.3
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