RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 SSH2Q76I76 1423 aa26.66■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC184Q52MB2 194 aa26.66■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R1AP30153 589 aa26.64■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.64■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.64■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.62■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 ORAI2Q96SN7 254 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 NME9Q86XW9 330 aa26.59■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 COG3Q96JB2 828 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 PIK3C2AO00443 1686 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.54■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.54■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 PSME1Q06323 249 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 USP54Q70EL1 1684 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 FOXO3O43524 673 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 USP31Q70CQ4 1352 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 SLAIN2Q9P270 581 aa26.51■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.51■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.48■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 MTHFSP49914 203 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 BRINP3Q76B58 766 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 ABTB2Q8N961 1025 aa26.45■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 NLRP6P59044 892 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP53Q96M91 514 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 PXDNQ92626 1479 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 ALS2Q96Q42 1657 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 SBNO1A3KN83 1393 aa26.4■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 POLKQ9UBT6 870 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 INSRP06213 1382 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 SHPRHQ149N8 1683 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 FBLN1P23142 703 aa26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.34■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SLIT3O75094 1523 aa26.32■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 USP19O94966 1318 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 NFAT5O94916 1531 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF10O15013 1369 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 PEAK1Q9H792 1746 aa26.29■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.29■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SOX12O15370 315 aa26.28■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.28■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.27■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 NUDCQ9Y266 331 aa26.27■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 TOM1O60784 492 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 LTN1O94822 1766 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 FLT4P35916 1363 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 GCP02774 474 aa26.23■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 RTL1A6NKG5 1358 aa26.22■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 AMPHP49418 695 aa26.2■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 IL13P35225 146 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 CERKQ8TCT0 537 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.17■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 HOXC9P31274 260 aa26.16■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 PHLPP1O60346 1717 aa26.14■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 ABCA3Q99758 1704 aa26.14■■□□□ 1.77
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