RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SMC5Q8IY18 1101 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 TRIM5Q9C035 493 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 TIGD1Q96MW7 591 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 BECN2A8MW95 431 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 11.3
PACS1-201ENST00000320580 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 FIBPO43427 364 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 KANK1Q14678 1352 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 DAPK1P53355 1430 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 CCDC27Q2M243 656 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 SNX21Q969T3 373 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.84e-7■■■□□ 18.5
PACS1-201ENST00000320580 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 TNNQ9UQP3 1299 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 ADCY5O95622 1261 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 SAMD9Q5K651 1589 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 HMMRO75330 724 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 HOMER1Q86YM7 354 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 RAPGEF3O95398 923 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 GCC1Q96CN9 775 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS1-201ENST00000320580 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 ABCC5O15440 1437 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.01■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 SMC3Q9UQE7 1217 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 RLBP1P12271 317 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 MNS1Q8NEH6 495 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 USP19O94966 1318 aa20■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 ERBINQ96RT1 1412 aa19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 MTHFSP49914 203 aa19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 GORABQ5T7V8 394 aa19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 WDR63Q8IWG1 891 aa19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 RBM25P49756 843 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 TSPYL1Q9H0U9 437 aa19.98■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.98■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 BICD2Q8TD16 824 aa19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 TNNT1P13805 278 aa19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 ZNF445P59923 1031 aa19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 CCDC192P0DO97 292 aa19.96■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.96■□□□□ 0.79
PACS1-201ENST00000320580 MCM2P49736 904 aa19.95■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 KRT222Q8N1A0 295 aa19.95■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 TRIM34Q9BYJ4 488 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 KIF14Q15058 1648 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 FBXW7Q969H0 707 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 OGFRQ9NZT2 677 aa19.94■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 TPM4P67936 248 aa19.93■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 FEZ1Q99689 392 aa19.93■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.93■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.93■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 TRIM27P14373 513 aa19.92■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 CCDC183Q5T5S1 534 aa19.91■□□□□ 0.78
PACS1-201ENST00000320580 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
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