RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 FYB1O15117 783 aa23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 ORAI2Q96SN7 254 aa23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF20-201ENST00000316412 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC184Q52MB2 194 aa23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOM1O60784 492 aa23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 MORC1Q86VD1 984 aa23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 NME9Q86XW9 330 aa23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPP2R1AP30153 589 aa23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 PIP4K2BP78356 416 aa23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 PIK3C2AO00443 1686 aa23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 NLRP13Q86W25 1043 aa23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 FOXO3O43524 673 aa23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLAIN2Q9P270 581 aa23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP54Q70EL1 1684 aa23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 PSME1Q06323 249 aa23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRS2Q9HD23 443 aa23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 BRINP3Q76B58 766 aa23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP31Q70CQ4 1352 aa23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 COG3Q96JB2 828 aa23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALS2Q96Q42 1657 aa23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 PXDNQ92626 1479 aa23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 HSPA1LP34931 641 aa23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABTB2Q8N961 1025 aa23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 SBNO1A3KN83 1393 aa23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 MTHFSP49914 203 aa23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 FBLN1P23142 703 aa23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 NLRP6P59044 892 aa23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 POLKQ9UBT6 870 aa23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHPRHQ149N8 1683 aa23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLIT3O75094 1523 aa23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 PEAK1Q9H792 1746 aa23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 INSRP06213 1382 aa23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 NFAT5O94916 1531 aa23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP19O94966 1318 aa23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 LTN1O94822 1766 aa23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF20-201ENST00000316412 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFAP53Q96M91 514 aa23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 SOX12O15370 315 aa23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGEF10O15013 1369 aa23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHLPP1O60346 1717 aa23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 GCP02774 474 aa23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCA3Q99758 1704 aa23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 FLT4P35916 1363 aa23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL13P35225 146 aa23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLEKHG5O94827 1062 aa23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 RTL1A6NKG5 1358 aa23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 HOXC9P31274 260 aa23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 AMPHP49418 695 aa23.14■■□□□ 1.29
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