RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.2■■■□□ 2.1
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MCM5P33992 734 aa28.18■■■□□ 2.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.18■■■□□ 2.1
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCA6Q8N139 1617 aa28.12■■■□□ 2.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBSNQ9H1K0 784 aa28.12■■■□□ 2.09
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP32Q8NFA0 1604 aa28.11■■■□□ 2.09
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC11Q96J66 1382 aa28.07■■■□□ 2.08
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.92■■■□□ 2.06
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.91■■■□□ 2.06
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.9■■■□□ 2.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.9■■■□□ 2.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.88■■■□□ 2.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKP1Q13835 747 aa27.88■■■□□ 2.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.88■■■□□ 2.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARID3AQ99856 593 aa27.87■■■□□ 2.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
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