RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299736.4

CENPV-201, Transcript of centromere protein V, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPV, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPV-201ENST00000299736 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.9■■■■□ 3.5
CENPV-201ENST00000299736 ATP7BP35670 1465 aa36.9■■■■□ 3.5
CENPV-201ENST00000299736 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.89■■■■□ 3.5
CENPV-201ENST00000299736 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CENPV-201ENST00000299736 BTG4Q9NY30 223 aa36.86■■■■□ 3.49
CENPV-201ENST00000299736 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
CENPV-201ENST00000299736 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.84■■■■□ 3.49
CENPV-201ENST00000299736 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.8■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 CDK19Q9BWU1 502 aa36.8■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 A0A0G2JS52 829 aa36.78■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 MYT1Q01538 1121 aa36.78■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.76■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
CENPV-201ENST00000299736 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.75■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 ACEP12821 1306 aa36.7■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.7■■■■□ 3.47
CENPV-201ENST00000299736 KIAA0232Q92628 1395 aa36.68■■■■□ 3.46
CENPV-201ENST00000299736 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.68■■■■□ 3.46
CENPV-201ENST00000299736 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.67■■■■□ 3.46
CENPV-201ENST00000299736 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.67■■■■□ 3.46
CENPV-201ENST00000299736 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.63■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.62■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 BAG6P46379 1132 aa36.62■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 CHRNA2Q15822 529 aa36.62■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.59■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.59■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.58■■■■□ 3.45
CENPV-201ENST00000299736 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 ABTB2Q8N961 1025 aa36.57■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.57■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 STRN4Q9NRL3 753 aa36.56■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 FAM182BQ5T319 152 aa36.54■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 USP19O94966 1318 aa36.52■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 CABP2Q9NPB3 220 aa36.51■■■■□ 3.44
CENPV-201ENST00000299736 CPDO75976 1380 aa36.51■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.5■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 SSH2Q76I76 1423 aa36.5■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 EVA1CP58658 441 aa36.49■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.48■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 NLRP13Q86W25 1043 aa36.48■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.48■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.46■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 DISP2A7MBM2 1401 aa36.46■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 LRP5O75197 1615 aa36.45■■■■□ 3.43
CENPV-201ENST00000299736 BARGINQ6ZT62 677 aa36.44■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 USP35Q9P2H5 1018 aa36.44■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 GCP02774 474 aa36.42■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 FAM196AQ6ZSG2 479 aa36.42■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 USP6P35125 1406 aa36.42■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 CABP1Q9NZU7 370 aa36.41■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CENPV-201ENST00000299736 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.38■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 EVC2Q86UK5 1308 aa36.37■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.37■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 TRIM37O94972 964 aa36.35■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 PDE3BQ13370 1112 aa36.35■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 SLIT3O75094 1523 aa36.34■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 NLRP6P59044 892 aa36.33■■■■□ 3.41
CENPV-201ENST00000299736 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 PIK3C2AO00443 1686 aa36.32■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 NEUROD1Q13562 356 aa36.3■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.29■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 AKAP12Q02952 1782 aa36.29■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.28■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.27■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 CRB1P82279 1406 aa36.27■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.26■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 APBA3O96018 575 aa36.26■■■■□ 3.4
CENPV-201ENST00000299736 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
CENPV-201ENST00000299736 COL18A1P39060 1754 aa36.25■■■■□ 3.39
CENPV-201ENST00000299736 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CENPV-201ENST00000299736 RREB1Q92766 1687 aa36.23■■■■□ 3.39
CENPV-201ENST00000299736 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.19■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.17■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.16■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.16■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 LRRC37A3O60309 1634 aa36.16■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.15■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 RGPD5Q99666 1765 aa36.15■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 PEAK1Q9H792 1746 aa36.14■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.14■■■■□ 3.38
CENPV-201ENST00000299736 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms