RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
ATMIN-201ENST00000299575 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.46■■□□□ 1.99
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF428Q96B54 188 aa27.46■■□□□ 1.99
ATMIN-201ENST00000299575 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
ATMIN-201ENST00000299575 CPLX1O14810 134 aa27.45■■□□□ 1.99
ATMIN-201ENST00000299575 BECN2A8MW95 431 aa27.44■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.44■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 TRDNQ13061 729 aa27.44■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 NFE2L2Q16236 605 aa27.43■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 CNTROBQ8N137 903 aa27.43■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 CLSTN1O94985 981 aa27.43■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.42■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 IDI1Q13907 227 aa27.41■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 CREBRFQ8IUR6 639 aa27.4■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ATMIN-201ENST00000299575 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.39■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 MAPKBP1O60336 1514 aa27.38■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 ARID3AQ99856 593 aa27.38■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 NEK4P51957 841 aa27.38■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.38■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM29Q14134 588 aa27.37■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 BICD2Q8TD16 824 aa27.37■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 FSD1Q9BTV5 496 aa27.37■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 RABEP1Q15276 862 aa27.37■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.35■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 VPS37DQ86XT2 251 aa27.35■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa27.35■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.34■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 FANCAO15360 1455 aa27.34■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 MARCH6O60337 910 aa27.33■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.33■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.33■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 WASHC4Q2M389 1173 aa27.33■■□□□ 1.97
ATMIN-201ENST00000299575 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 ATP10BO94823 1461 aa27.32■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.32■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 MCM2P49736 904 aa27.32■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 PSMA5P28066 241 aa27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 NOS1P29475 1434 aa27.3■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.3■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 TRAK2O60296 914 aa27.29■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.29■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.29■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.28■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 ABCC11Q96J66 1382 aa27.28■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 NME9Q86XW9 330 aa27.28■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ATMIN-201ENST00000299575 HIP1O00291 1037 aa27.26■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.26■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 MRE11P49959 708 aa27.25■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 ERICH2A1L162 156 aa27.24■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 PES1O00541 588 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 MSH5O43196 834 aa27.24■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.23■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 STRN4Q9NRL3 753 aa27.23■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.23■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 MCM10Q7L590 875 aa27.23■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 TPM3P06753 285 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 FOSBP53539 338 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 DCTN1Q14203 1278 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 IFT57Q9NWB7 429 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 SPG7Q9UQ90 795 aa27.22■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.21■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 CABP4P57796 275 aa27.21■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 SRGAP3O43295 1099 aa27.21■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 VPS53Q5VIR6 699 aa27.21■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.21■■□□□ 1.95
ATMIN-201ENST00000299575 PLCH2O75038 1416 aa27.2■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.2■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 BTBD11A6QL63 1104 aa27.19■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.19■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 MBD3O95983 291 aa27.19■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.18■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ATMIN-201ENST00000299575 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms