RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293695.7

SYCE2-201, Transcript of synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE2, Length 1,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2-201ENST00000293695 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SYCE2-201ENST00000293695 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.72■□□□□ 0.91
SYCE2-201ENST00000293695 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SYCE2-201ENST00000293695 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.71■□□□□ 0.91
SYCE2-201ENST00000293695 VPS72Q15906 364 aa20.7■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 EP400Q96L91 3159 aa20.7■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 NRAPQ86VF7 1730 aa20.7■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 FAM83GA6ND36 823 aa20.69■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 ACEP12821 1306 aa20.68■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.66■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.66■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.65■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 BTG4Q9NY30 223 aa20.65■□□□□ 0.9
SYCE2-201ENST00000293695 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.64■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 CABP2Q9NPB3 220 aa20.63■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 CCDC125Q86Z20 511 aa20.62■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.62■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.61■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 EVC2Q86UK5 1308 aa20.6■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 A0A0G2JS52 829 aa20.6■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 MYT1Q01538 1121 aa20.6■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 ABTB2Q8N961 1025 aa20.6■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 KIAA0232Q92628 1395 aa20.59■□□□□ 0.89
SYCE2-201ENST00000293695 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.57■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.56■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 CABP1Q9NZU7 370 aa20.56■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 TONSLQ96HA7 1378 aa20.56■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 CHRNA2Q15822 529 aa20.55■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 NLRP13Q86W25 1043 aa20.55■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.54■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.54■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 USP6P35125 1406 aa20.53■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 AKAP12Q02952 1782 aa20.53■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 USP19O94966 1318 aa20.53■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 STRN4Q9NRL3 753 aa20.52■□□□□ 0.88
SYCE2-201ENST00000293695 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.51■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.51■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 CPDO75976 1380 aa20.5■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 EVA1CP58658 441 aa20.5■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.49■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 GCP02774 474 aa20.49■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.49■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 PIK3C2AO00443 1686 aa20.48■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 NLRP6P59044 892 aa20.48■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.48■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.47■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.47■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 SSH2Q76I76 1423 aa20.46■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.46■□□□□ 0.87
SYCE2-201ENST00000293695 SLIT3O75094 1523 aa20.45■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 USP35Q9P2H5 1018 aa20.45■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.44■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.43■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.43■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.42■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.42■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 BAG6P46379 1132 aa20.41■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 FAM182BQ5T319 152 aa20.4■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 BARGINQ6ZT62 677 aa20.4■□□□□ 0.86
SYCE2-201ENST00000293695 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.39■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.39■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 COL18A1P39060 1754 aa20.39■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 RGPD5Q99666 1765 aa20.39■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.38■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 PDE3BQ13370 1112 aa20.37■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 TMC1Q8TDI8 760 aa20.37■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 CRB1P82279 1406 aa20.36■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.36■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 SOX12O15370 315 aa20.34■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.33■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 USP54Q70EL1 1684 aa20.33■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.33■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 SLC24A1O60721 1099 aa20.33■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SYCE2-201ENST00000293695 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.32■□□□□ 0.84
SYCE2-201ENST00000293695 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.32■□□□□ 0.84
SYCE2-201ENST00000293695 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.32■□□□□ 0.84
SYCE2-201ENST00000293695 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SYCE2-201ENST00000293695 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms