RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
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PTPRB-201ENST00000261266 VPS37DQ86XT2 251 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRB-201ENST00000261266 GNAI2P04899 355 aa10.88□□□□□ -0.67
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PTPRB-201ENST00000261266 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.88□□□□□ -0.67
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PTPRB-201ENST00000261266 NLRP6P59044 892 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRB-201ENST00000261266 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PTPRB-201ENST00000261266 BICD2Q8TD16 824 aa10.84□□□□□ -0.67
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PTPRB-201ENST00000261266 IL16Q14005 1332 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 WASF1Q92558 559 aa10.8□□□□□ -0.68
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PTPRB-201ENST00000261266 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 NFE2L2Q16236 605 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRB-201ENST00000261266 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
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