RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 ATP2B4P23634 1241 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 SCNN1AP37088 669 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 FUT2Q10981 343 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 PROX2Q3B8N5 592 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 LHX6Q9UPM6 363 aa9.33□□□□□ -0.92
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MDM2-201ENST00000258148 DESI1Q6ICB0 168 aa9.3□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.3□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 RASA1P20936 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
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MDM2-201ENST00000258148 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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MDM2-201ENST00000258148 DPYDQ12882 1025 aa9.25□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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MDM2-201ENST00000258148 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.24□□□□□ -0.93
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MDM2-201ENST00000258148 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.23□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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MDM2-201ENST00000258148 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 MORN1Q5T089 497 aa9.2□□□□□ -0.94
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MDM2-201ENST00000258148 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.19□□□□□ -0.94
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MDM2-201ENST00000258148 UBXN4Q92575 508 aa9.18□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
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MDM2-201ENST00000258148 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.16□□□□□ -0.94
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MDM2-201ENST00000258148 Q3C1V9 767 aa9.15□□□□□ -0.94
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MDM2-201ENST00000258148 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 C21orf2O43822 256 aa9.14□□□□□ -0.95
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