RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PANK1Q8TE04 598 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NME9Q86XW9 330 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PTMSP20962 102 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NGLY1Q96IV0 654 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC4A2P04920 1241 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.95□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MARCH6O60337 910 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM161AQ3B820 660 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WDR63Q8IWG1 891 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRDNQ13061 729 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.94□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MSH6P52701 1360 aa14.93□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BTBD11A6QL63 1104 aa14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TOM1O60784 492 aa14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RNF20Q5VTR2 975 aa14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LNPKQ9C0E8 428 aa14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NFE2L2Q16236 605 aa14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.92□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RAD21O60216 631 aa14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VPS53Q5VIR6 699 aa14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.91□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WWC1Q8IX03 1113 aa14.9□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.9□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.9□□□□□ -0.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 STARD3NLO95772 234 aa14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MYL6BP14649 208 aa14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 H3BQV1 296 aa14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WASHC4Q2M389 1173 aa14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IFFO2Q5TF58 517 aa14.89□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GNAI2P04899 355 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WDR97A6NE52 1622 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC27Q2M243 656 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.88□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DRC7Q8IY82 874 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ACEP12821 1306 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CPLX1O14810 134 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PDE4AP27815 886 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF428Q96B54 188 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HSPA2P54652 639 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PDE3AQ14432 1141 aa14.87□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZMYM3Q14202 1370 aa14.86□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ERICH2A1L162 156 aa14.85□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EXOC5O00471 708 aa14.85□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.84□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.84□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.84□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DISP1Q96F81 1524 aa14.83□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRIM29Q14134 588 aa14.83□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FSD1Q9BTV5 496 aa14.83□□□□□ -0.03
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NSD2O96028 1365 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TPM4P67936 248 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.83□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PTPRKQ15262 1439 aa14.82□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MCM10Q7L590 875 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms