RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.35■■□□□ 1.49
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CBX1-201ENST00000225603 SSH2Q76I76 1423 aa24.33■■□□□ 1.49
CBX1-201ENST00000225603 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.33■■□□□ 1.48
CBX1-201ENST00000225603 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.32■■□□□ 1.48
CBX1-201ENST00000225603 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.32■■□□□ 1.48
CBX1-201ENST00000225603 MSH6P52701 1360 aa24.32■■□□□ 1.48
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CBX1-201ENST00000225603 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.31■■□□□ 1.48
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CBX1-201ENST00000225603 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.23■■□□□ 1.47
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CBX1-201ENST00000225603 COG3Q96JB2 828 aa24.23■■□□□ 1.47
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CBX1-201ENST00000225603 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.2■■□□□ 1.46
CBX1-201ENST00000225603 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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CBX1-201ENST00000225603 PIK3C2AO00443 1686 aa24.18■■□□□ 1.46
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CBX1-201ENST00000225603 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.15■■□□□ 1.46
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CBX1-201ENST00000225603 BRINP3Q76B58 766 aa24.15■■□□□ 1.46
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CBX1-201ENST00000225603 CCDC146Q8IYE0 955 aa24■■□□□ 1.43
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CBX1-201ENST00000225603 AMPHP49418 695 aa23.94■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.94■■□□□ 1.42
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CBX1-201ENST00000225603 FLT4P35916 1363 aa23.92■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.92■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.92■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 HOXC9P31274 260 aa23.91■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 FKBP8Q14318 412 aa23.91■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 APAF1O14727 1248 aa23.9■■□□□ 1.42
CBX1-201ENST00000225603 ARHGEF10O15013 1369 aa23.89■■□□□ 1.41
CBX1-201ENST00000225603 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.89■■□□□ 1.41
CBX1-201ENST00000225603 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.88■■□□□ 1.41
CBX1-201ENST00000225603 NEFLP07196 543 aa23.88■■□□□ 1.41
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