RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.34■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 COG3Q96JB2 828 aa22.34■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.33■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.33■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.33■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 PDE3BQ13370 1112 aa22.31■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.31■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 C14orf37Q86TY3 774 aa22.31■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 SHPRHQ149N8 1683 aa22.3■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.3■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 POLKQ9UBT6 870 aa22.3■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.3■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.28■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 NGEFQ8N5V2 710 aa22.28■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.28■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.27■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 NUDCQ9Y266 331 aa22.27■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.27■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.27■■□□□ 1.16
TVP23C-201ENST00000225576 USP31Q70CQ4 1352 aa22.25■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.24■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 RUNDC1Q96C34 613 aa22.23■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM94Q12767 1356 aa22.23■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 APAF1O14727 1248 aa22.22■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 FBLN1P23142 703 aa22.22■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.151e-11■■■□□ 15.4
TVP23C-201ENST00000225576 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.21■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.21■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF521Q96K83 1311 aa22.2■■□□□ 1.15
TVP23C-201ENST00000225576 DCCP43146 1447 aa22.2■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.2■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.2■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 NEFLP07196 543 aa22.17■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.17■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 ATF3P18847 181 aa22.16■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 PSME1Q06323 249 aa22.16■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 ORAI2Q96SN7 254 aa22.16■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP6P59044 892 aa22.15■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.15■■□□□ 1.14
TVP23C-201ENST00000225576 PIK3C2AO00443 1686 aa22.14■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 IL13P35225 146 aa22.14■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 GOLGA2Q08379 1002 aa22.14■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.14■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.14■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 FCHSD2O94868 740 aa22.13■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.13■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 ABTB2Q8N961 1025 aa22.13■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.13■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.13■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 USP54Q70EL1 1684 aa22.12■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 MST1RQ04912 1400 aa22.12■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC27Q2M243 656 aa22.11■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 MSH6P52701 1360 aa22.11■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 FOXO3O43524 673 aa22.1■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 FKBP8Q14318 412 aa22.1■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 KIF1AQ12756 1690 aa22.09■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 WWC1Q8IX03 1113 aa22.09■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.08■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.08■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 SLFN5Q08AF3 891 aa22.08■■□□□ 1.13
TVP23C-201ENST00000225576 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.08■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.07■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 SBNO1A3KN83 1393 aa22.06■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.06■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 CERKQ8TCT0 537 aa22.06■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.06■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 E9PSI1 815 aa22.06■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 FLT4P35916 1363 aa22.05■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.05■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.05■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 WDR63Q8IWG1 891 aa22.05■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 SOX12O15370 315 aa22.04■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 NEUROD2Q15784 382 aa22.04■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.04■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TVP23C-201ENST00000225576 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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