RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 RLBP1P12271 317 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-201ENST00000215941 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-201ENST00000215941 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-201ENST00000215941 EVC2Q86UK5 1308 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 FSD2A1L4K1 749 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 STK26Q9P289 416 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 MCM4P33991 863 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD54-201ENST00000215941 NEUROD2Q15784 382 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 ALKQ9UM73 1620 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRMP28827 1452 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 MTHFSP49914 203 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 CABP2Q9NPB3 220 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 TNNQ9UQP3 1299 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 PRAM1Q96QH2 718 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 IL16Q14005 1332 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 MRE11P49959 708 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 SMC5Q8IY18 1101 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC11Q96J66 1382 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
ANKRD54-201ENST00000215941 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 HSCBQ8IWL3 235 aa28.76■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAK2O60296 914 aa28.75■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 CLCN1P35523 988 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 SNX21Q969T3 373 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.72■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.72■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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ANKRD54-201ENST00000215941 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM27P14373 513 aa28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 PTMSP20962 102 aa28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.71■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 DDIT3P35638 169 aa28.7■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 TNRQ92752 1358 aa28.7■■■□□ 2.19
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 DLC1Q96QB1 1528 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF16BQ96L93 1317 aa28.68■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.68■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1W2PP64 1363 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 MED14O60244 1454 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 CDK19Q9BWU1 502 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD54-201ENST00000215941 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 NUCB1Q02818 461 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF428Q96B54 188 aa28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 GBP4Q96PP9 640 aa28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.59■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 PANK2Q9BZ23 570 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD54-201ENST00000215941 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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