RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 USP6P35125 1406 aa25.35■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 PSME1Q06323 249 aa25.34■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHG5O94827 1062 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT1-201ENST00000211413 FBLN1P23142 703 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC184Q52MB2 194 aa25.31■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 PIP4K2BP78356 416 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 CERKQ8TCT0 537 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 SSH2Q76I76 1423 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRT1-201ENST00000211413 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.25■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 MORC1Q86VD1 984 aa25.25■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.25■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 KIF1AQ12756 1690 aa25.24■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.24■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 SOX12O15370 315 aa25.24■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 ABTB2Q8N961 1025 aa25.23■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 PIK3C2AO00443 1686 aa25.21■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.21■■□□□ 1.63
PRRT1-201ENST00000211413 RALBP1Q15311 655 aa25.2■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP6P59044 892 aa25.2■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 TOM1O60784 492 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 PPP2R1AP30153 589 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 COG3Q96JB2 828 aa25.18■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 PXDNQ92626 1479 aa25.17■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.16■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRRT1-201ENST00000211413 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 NSD2O96028 1365 aa25.14■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.12■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 MRS2Q9HD23 443 aa25.11■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 MTHFSP49914 203 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 ALS2Q96Q42 1657 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT1-201ENST00000211413 USP31Q70CQ4 1352 aa25.08■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP13Q86W25 1043 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 POLKQ9UBT6 870 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 SBNO1A3KN83 1393 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 CCER2I3L3R5 266 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.05■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 PHLPP1O60346 1717 aa25.03■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 GCP02774 474 aa25.02■■□□□ 1.6
PRRT1-201ENST00000211413 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 USP19O94966 1318 aa24.98■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 USP54Q70EL1 1684 aa24.98■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 PEAK1Q9H792 1746 aa24.97■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.96■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF10O15013 1369 aa24.95■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 NFAT5O94916 1531 aa24.95■■□□□ 1.59
PRRT1-201ENST00000211413 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.95■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 SLIT3O75094 1523 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 LTN1O94822 1766 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 HSPA1LP34931 641 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 CHRNA2Q15822 529 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 AMPHP49418 695 aa24.92■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.92■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.9■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.89■■□□□ 1.58
PRRT1-201ENST00000211413 HOXC9P31274 260 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PRRT1-201ENST00000211413 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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