RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 AFMIDQ63HM1 303 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TIFAQ96CG3 184 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC11Q96DB2 347 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FMO2Q99518 471 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 F5H5T6 163 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTN5O94779 1100 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPLNO95428 1278 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 LATS1O95835 1130 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CAV1Q03135 178 aa25.58■■□□□ 1.68
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CAPNS1-215ENST00000628018 AP1B1Q10567 949 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNC3Q14003 757 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ALFQ53S48 1182 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNYQ8ND76 341 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MYEOVQ96EZ4 313 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 DONSONQ9NYP3 566 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF212Q9UDV6 495 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TRANK1O15050 2925 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf60A6NFR6 353 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 GREM1O60565 184 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 GCATO75600 419 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CKMP06732 381 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRF1Q5T601 910 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 LGI2Q8N0V4 545 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY11Q96G91 374 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 FUT8Q9BYC5 575 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PAK5Q9P286 719 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NOTCH4Q99466 2003 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RFXAPO00287 272 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTN2P35609 894 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF33AQ06730 810 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RFWD3Q6PCD5 774 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A8Q9C0K1 460 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RETREG1Q9H6L5 497 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 DOCK6Q96HP0 2047 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SOBPA7XYQ1 873 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NDC80O14777 642 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NDST2P52849 883 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR158Q5T848 1215 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf22Q6V702 233 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZNB5 142 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PCGF5Q86SE9 256 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 FERMT1Q9BQL6 677 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMA3Q16787 3333 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NTHL1P78549 312 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TEAD2Q15562 447 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 HDXQ7Z353 690 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC110Q8TBZ0 833 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TSGA13Q96PP4 275 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PRO3102Q9H379 93 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TASP1Q9H6P5 420 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP205Q92621 2012 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP8B1O43520 1251 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 WASHC5Q12768 1159 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP8Q14790 479 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MORF4L2Q15014 288 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RABGAP1LQ5R372 815 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MREGQ8N565 214 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CPT1BQ92523 772 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.53■■□□□ 1.68
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