RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ING2	Q9H160	280 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RYR2	Q92736	4967 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf142	B7Z368	130 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	BMP7	P18075	431 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	NPEPPS	P55786	919 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK10	P57789	538 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB15	P59190	212 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	HAND2	P61296	217 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	KEAP1	Q14145	624 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	EMC2	Q15006	297 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DDR2	Q16832	855 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	GEN1	Q17RS7	908 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP9	Q49MG5	647 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ANO5	Q75V66	913 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF366	Q8N895	744 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	GRHL3	Q8TE85	626 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP170P1	Q96L14	293 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT9	Q9BW91	350 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DCLK3	Q9C098	648 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	GULP1	Q9UBP9	304 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FZD4	Q9ULV1	537 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIP11	Q15643	1979 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	DRGX	A6NNA5	263 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	JRK	O75564	520 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	OLFM2	O95897	454 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM157C	P0CG43	387 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ODC1	P11926	461 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCG1	P19174	1290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ADPRH	P54922	357 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	DMTN	Q08495	405 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPS	Q13938	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ECM1	Q16610	540 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440		Q5PR19	223 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKS6	Q68DC2	871 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ESX1	Q8N693	406 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13H1	Q8NG92	308 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FAR1	Q8WVX9	515 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP4	Q8WY91	577 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	WASF1	Q92558	559 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	INPP5D	Q92835	1189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	BHMT	Q93088	406 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MTR	Q99707	1265 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MYOC	Q99972	504 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR83	Q9NYM4	423 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PPME1	Q9Y570	386 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MID1	O15344	667 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CREG1	O75629	220 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CEACAM4	O75871	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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