RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 CFIP05156 583 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNA4P22459 653 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 CXCR3P49682 368 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 TPMTP51580 245 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ECT2LQ008S8 904 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 FMO1Q01740 532 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 SULT2A1Q06520 285 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 TBCBQ99426 244 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 CD93Q9NPY3 652 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 PATE3B3GLJ2 98 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 CLDN11O75508 207 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 GNSP15586 552 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 PDGFRAP16234 1089 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 FERP16591 822 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 MMP8P22894 467 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 FLT3P36888 993 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB16Q05516 673 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ARCQ7LC44 396 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM124AQ86V42 546 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM1BQ8NB78 822 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 NT5C3BQ969T7 300 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 LMLNQ96KR4 655 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR174Q9BXC1 333 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 PRSS16Q9NQE7 514 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 SUSD2Q9UGT4 822 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.59■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.58■□□□□ 0.25
EFTUD2-215ENST00000589825 LNP1A1A4G5 178 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ADCY5O95622 1261 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SERPINC1P01008 464 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CALB1P05937 261 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CHRNB2P17787 502 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SDC4P31431 198 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 GGCXP38435 758 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CDH4P55283 916 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 IRX4P78413 519 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CENPCQ03188 943 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 APCDD1Q8J025 514 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 GANCQ8TET4 914 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 IGSF8Q969P0 613 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 AGPAT1Q99943 283 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC6A14Q9UN76 642 aa16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SYCE3A1L190 88 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD62A6NC57 917 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 C4orf47A7E2U8 309 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 DESP17661 470 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP11AP98196 1134 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CDO1Q16878 200 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC23A3Q6PIS1 610 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms